Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LINC00301Q8NCQ3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LINC00301Q8NCQ3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LINC00301Q8NCQ3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LINC00301Q8NCQ3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LINC00301Q8NCQ3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LINC00301Q8NCQ3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LINC00301Q8NCQ3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LINC00301Q8NCQ3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LINC00301Q8NCQ3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LINC00301Q8NCQ3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LINC00301Q8NCQ3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LINC00301Q8NCQ3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LINC00301Q8NCQ3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LINC00301Q8NCQ3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LINC00301Q8NCQ3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LINC00301Q8NCQ3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LINC00301Q8NCQ3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LINC00301Q8NCQ3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LINC00301Q8NCQ3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LINC00301Q8NCQ3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LINC00301Q8NCQ3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LINC00301Q8NCQ3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LINC00301Q8NCQ3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LINC00301Q8NCQ3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LINC00301Q8NCQ3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LINC00301Q8NCQ3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LINC00301Q8NCQ3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LINC00301Q8NCQ3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LINC00301Q8NCQ3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LINC00301Q8NCQ3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LINC00301Q8NCQ3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LINC00301Q8NCQ3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LINC00301Q8NCQ3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LINC00301Q8NCQ3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LINC00301Q8NCQ3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LINC00301Q8NCQ3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LINC00301Q8NCQ3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LINC00301Q8NCQ3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LINC00301Q8NCQ3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LINC00301Q8NCQ3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LINC00301Q8NCQ3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LINC00301Q8NCQ3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LINC00301Q8NCQ3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
LINC00301Q8NCQ3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
LINC00301Q8NCQ3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LINC00301Q8NCQ3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
LINC00301Q8NCQ3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LINC00301Q8NCQ3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LINC00301Q8NCQ3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LINC00301Q8NCQ3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
LINC00301Q8NCQ3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
LINC00301Q8NCQ3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
LINC00301Q8NCQ3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LINC00301Q8NCQ3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LINC00301Q8NCQ3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LINC00301Q8NCQ3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LINC00301Q8NCQ3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LINC00301Q8NCQ3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LINC00301Q8NCQ3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LINC00301Q8NCQ3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
LINC00301Q8NCQ3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LINC00301Q8NCQ3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LINC00301Q8NCQ3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LINC00301Q8NCQ3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LINC00301Q8NCQ3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LINC00301Q8NCQ3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LINC00301Q8NCQ3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LINC00301Q8NCQ3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LINC00301Q8NCQ3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LINC00301Q8NCQ3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LINC00301Q8NCQ3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LINC00301Q8NCQ3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LINC00301Q8NCQ3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LINC00301Q8NCQ3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LINC00301Q8NCQ3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LINC00301Q8NCQ3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LINC00301Q8NCQ3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LINC00301Q8NCQ3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LINC00301Q8NCQ3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LINC00301Q8NCQ3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LINC00301Q8NCQ3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LINC00301Q8NCQ3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LINC00301Q8NCQ3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LINC00301Q8NCQ3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LINC00301Q8NCQ3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LINC00301Q8NCQ3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LINC00301Q8NCQ3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LINC00301Q8NCQ3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LINC00301Q8NCQ3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LINC00301Q8NCQ3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LINC00301Q8NCQ3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LINC00301Q8NCQ3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LINC00301Q8NCQ3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LINC00301Q8NCQ3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LINC00301Q8NCQ3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LINC00301Q8NCQ3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LINC00301Q8NCQ3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LINC00301Q8NCQ3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LINC00301Q8NCQ3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms