Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HJURPQ8NCD3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HJURPQ8NCD3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HJURPQ8NCD3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HJURPQ8NCD3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HJURPQ8NCD3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HJURPQ8NCD3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HJURPQ8NCD3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HJURPQ8NCD3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HJURPQ8NCD3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HJURPQ8NCD3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HJURPQ8NCD3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HJURPQ8NCD3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HJURPQ8NCD3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HJURPQ8NCD3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HJURPQ8NCD3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HJURPQ8NCD3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HJURPQ8NCD3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HJURPQ8NCD3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HJURPQ8NCD3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HJURPQ8NCD3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HJURPQ8NCD3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HJURPQ8NCD3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HJURPQ8NCD3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HJURPQ8NCD3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HJURPQ8NCD3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HJURPQ8NCD3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HJURPQ8NCD3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HJURPQ8NCD3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HJURPQ8NCD3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HJURPQ8NCD3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HJURPQ8NCD3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HJURPQ8NCD3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HJURPQ8NCD3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HJURPQ8NCD3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HJURPQ8NCD3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HJURPQ8NCD3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HJURPQ8NCD3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HJURPQ8NCD3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HJURPQ8NCD3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HJURPQ8NCD3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HJURPQ8NCD3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HJURPQ8NCD3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HJURPQ8NCD3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HJURPQ8NCD3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
HJURPQ8NCD3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
HJURPQ8NCD3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
HJURPQ8NCD3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HJURPQ8NCD3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HJURPQ8NCD3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HJURPQ8NCD3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HJURPQ8NCD3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HJURPQ8NCD3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HJURPQ8NCD3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HJURPQ8NCD3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HJURPQ8NCD3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HJURPQ8NCD3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HJURPQ8NCD3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HJURPQ8NCD3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HJURPQ8NCD3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HJURPQ8NCD3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HJURPQ8NCD3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HJURPQ8NCD3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HJURPQ8NCD3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HJURPQ8NCD3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HJURPQ8NCD3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HJURPQ8NCD3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HJURPQ8NCD3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HJURPQ8NCD3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HJURPQ8NCD3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HJURPQ8NCD3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HJURPQ8NCD3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HJURPQ8NCD3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HJURPQ8NCD3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HJURPQ8NCD3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HJURPQ8NCD3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HJURPQ8NCD3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HJURPQ8NCD3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HJURPQ8NCD3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HJURPQ8NCD3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HJURPQ8NCD3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HJURPQ8NCD3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HJURPQ8NCD3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HJURPQ8NCD3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HJURPQ8NCD3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HJURPQ8NCD3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HJURPQ8NCD3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HJURPQ8NCD3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HJURPQ8NCD3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HJURPQ8NCD3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HJURPQ8NCD3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HJURPQ8NCD3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HJURPQ8NCD3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HJURPQ8NCD3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HJURPQ8NCD3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HJURPQ8NCD3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HJURPQ8NCD3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HJURPQ8NCD3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HJURPQ8NCD3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HJURPQ8NCD3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms