Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6G5

CSGALNACT2, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSGALNACT2Q8N6G5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSGALNACT2Q8N6G5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSGALNACT2Q8N6G5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSGALNACT2Q8N6G5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSGALNACT2Q8N6G5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSGALNACT2Q8N6G5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSGALNACT2Q8N6G5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSGALNACT2Q8N6G5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSGALNACT2Q8N6G5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSGALNACT2Q8N6G5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSGALNACT2Q8N6G5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSGALNACT2Q8N6G5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSGALNACT2Q8N6G5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSGALNACT2Q8N6G5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSGALNACT2Q8N6G5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSGALNACT2Q8N6G5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSGALNACT2Q8N6G5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSGALNACT2Q8N6G5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSGALNACT2Q8N6G5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSGALNACT2Q8N6G5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSGALNACT2Q8N6G5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSGALNACT2Q8N6G5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSGALNACT2Q8N6G5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSGALNACT2Q8N6G5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSGALNACT2Q8N6G5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSGALNACT2Q8N6G5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSGALNACT2Q8N6G5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSGALNACT2Q8N6G5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSGALNACT2Q8N6G5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSGALNACT2Q8N6G5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSGALNACT2Q8N6G5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSGALNACT2Q8N6G5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSGALNACT2Q8N6G5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CSGALNACT2Q8N6G5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSGALNACT2Q8N6G5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSGALNACT2Q8N6G5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSGALNACT2Q8N6G5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSGALNACT2Q8N6G5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSGALNACT2Q8N6G5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CSGALNACT2Q8N6G5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSGALNACT2Q8N6G5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSGALNACT2Q8N6G5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSGALNACT2Q8N6G5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSGALNACT2Q8N6G5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSGALNACT2Q8N6G5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSGALNACT2Q8N6G5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSGALNACT2Q8N6G5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CSGALNACT2Q8N6G5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSGALNACT2Q8N6G5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSGALNACT2Q8N6G5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSGALNACT2Q8N6G5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSGALNACT2Q8N6G5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSGALNACT2Q8N6G5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSGALNACT2Q8N6G5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSGALNACT2Q8N6G5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSGALNACT2Q8N6G5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSGALNACT2Q8N6G5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSGALNACT2Q8N6G5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSGALNACT2Q8N6G5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSGALNACT2Q8N6G5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSGALNACT2Q8N6G5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSGALNACT2Q8N6G5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSGALNACT2Q8N6G5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSGALNACT2Q8N6G5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSGALNACT2Q8N6G5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSGALNACT2Q8N6G5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSGALNACT2Q8N6G5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSGALNACT2Q8N6G5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSGALNACT2Q8N6G5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSGALNACT2Q8N6G5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSGALNACT2Q8N6G5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSGALNACT2Q8N6G5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSGALNACT2Q8N6G5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSGALNACT2Q8N6G5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSGALNACT2Q8N6G5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSGALNACT2Q8N6G5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSGALNACT2Q8N6G5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSGALNACT2Q8N6G5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSGALNACT2Q8N6G5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSGALNACT2Q8N6G5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSGALNACT2Q8N6G5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSGALNACT2Q8N6G5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSGALNACT2Q8N6G5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSGALNACT2Q8N6G5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSGALNACT2Q8N6G5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CSGALNACT2Q8N6G5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CSGALNACT2Q8N6G5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CSGALNACT2Q8N6G5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSGALNACT2Q8N6G5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSGALNACT2Q8N6G5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSGALNACT2Q8N6G5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CSGALNACT2Q8N6G5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CSGALNACT2Q8N6G5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms