Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYU2

HACE1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, humanhuman

Predictions only

Length 909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACE1Q8IYU2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HACE1Q8IYU2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HACE1Q8IYU2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HACE1Q8IYU2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HACE1Q8IYU2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HACE1Q8IYU2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HACE1Q8IYU2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HACE1Q8IYU2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HACE1Q8IYU2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HACE1Q8IYU2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HACE1Q8IYU2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HACE1Q8IYU2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HACE1Q8IYU2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HACE1Q8IYU2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HACE1Q8IYU2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HACE1Q8IYU2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HACE1Q8IYU2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HACE1Q8IYU2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HACE1Q8IYU2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HACE1Q8IYU2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HACE1Q8IYU2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HACE1Q8IYU2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HACE1Q8IYU2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HACE1Q8IYU2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HACE1Q8IYU2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HACE1Q8IYU2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HACE1Q8IYU2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HACE1Q8IYU2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HACE1Q8IYU2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HACE1Q8IYU2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HACE1Q8IYU2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HACE1Q8IYU2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HACE1Q8IYU2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HACE1Q8IYU2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HACE1Q8IYU2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HACE1Q8IYU2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HACE1Q8IYU2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HACE1Q8IYU2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
HACE1Q8IYU2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
HACE1Q8IYU2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HACE1Q8IYU2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HACE1Q8IYU2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HACE1Q8IYU2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
HACE1Q8IYU2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
HACE1Q8IYU2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
HACE1Q8IYU2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
HACE1Q8IYU2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
HACE1Q8IYU2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
HACE1Q8IYU2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HACE1Q8IYU2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HACE1Q8IYU2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HACE1Q8IYU2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HACE1Q8IYU2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HACE1Q8IYU2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HACE1Q8IYU2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HACE1Q8IYU2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HACE1Q8IYU2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HACE1Q8IYU2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HACE1Q8IYU2 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HACE1Q8IYU2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HACE1Q8IYU2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HACE1Q8IYU2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HACE1Q8IYU2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HACE1Q8IYU2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HACE1Q8IYU2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HACE1Q8IYU2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HACE1Q8IYU2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HACE1Q8IYU2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HACE1Q8IYU2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HACE1Q8IYU2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HACE1Q8IYU2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HACE1Q8IYU2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HACE1Q8IYU2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HACE1Q8IYU2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HACE1Q8IYU2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HACE1Q8IYU2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HACE1Q8IYU2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HACE1Q8IYU2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HACE1Q8IYU2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HACE1Q8IYU2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HACE1Q8IYU2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HACE1Q8IYU2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HACE1Q8IYU2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HACE1Q8IYU2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HACE1Q8IYU2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HACE1Q8IYU2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HACE1Q8IYU2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
HACE1Q8IYU2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HACE1Q8IYU2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HACE1Q8IYU2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HACE1Q8IYU2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HACE1Q8IYU2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HACE1Q8IYU2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HACE1Q8IYU2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HACE1Q8IYU2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HACE1Q8IYU2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HACE1Q8IYU2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HACE1Q8IYU2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HACE1Q8IYU2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HACE1Q8IYU2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms