Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI2

RHOT1, Mitochondrial Rho GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT1Q8IXI2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOT1Q8IXI2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOT1Q8IXI2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOT1Q8IXI2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOT1Q8IXI2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOT1Q8IXI2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RHOT1Q8IXI2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHOT1Q8IXI2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHOT1Q8IXI2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHOT1Q8IXI2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHOT1Q8IXI2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHOT1Q8IXI2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHOT1Q8IXI2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHOT1Q8IXI2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHOT1Q8IXI2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHOT1Q8IXI2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHOT1Q8IXI2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHOT1Q8IXI2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHOT1Q8IXI2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHOT1Q8IXI2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHOT1Q8IXI2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHOT1Q8IXI2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHOT1Q8IXI2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHOT1Q8IXI2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHOT1Q8IXI2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RHOT1Q8IXI2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHOT1Q8IXI2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHOT1Q8IXI2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHOT1Q8IXI2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHOT1Q8IXI2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHOT1Q8IXI2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHOT1Q8IXI2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHOT1Q8IXI2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHOT1Q8IXI2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHOT1Q8IXI2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RHOT1Q8IXI2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RHOT1Q8IXI2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RHOT1Q8IXI2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RHOT1Q8IXI2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RHOT1Q8IXI2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RHOT1Q8IXI2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RHOT1Q8IXI2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RHOT1Q8IXI2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RHOT1Q8IXI2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RHOT1Q8IXI2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHOT1Q8IXI2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHOT1Q8IXI2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHOT1Q8IXI2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHOT1Q8IXI2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHOT1Q8IXI2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHOT1Q8IXI2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHOT1Q8IXI2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHOT1Q8IXI2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHOT1Q8IXI2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHOT1Q8IXI2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHOT1Q8IXI2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHOT1Q8IXI2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHOT1Q8IXI2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHOT1Q8IXI2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHOT1Q8IXI2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHOT1Q8IXI2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHOT1Q8IXI2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHOT1Q8IXI2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHOT1Q8IXI2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHOT1Q8IXI2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RHOT1Q8IXI2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHOT1Q8IXI2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOT1Q8IXI2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOT1Q8IXI2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOT1Q8IXI2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOT1Q8IXI2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOT1Q8IXI2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOT1Q8IXI2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOT1Q8IXI2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOT1Q8IXI2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOT1Q8IXI2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOT1Q8IXI2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOT1Q8IXI2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOT1Q8IXI2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOT1Q8IXI2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHOT1Q8IXI2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHOT1Q8IXI2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHOT1Q8IXI2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RHOT1Q8IXI2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHOT1Q8IXI2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHOT1Q8IXI2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHOT1Q8IXI2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHOT1Q8IXI2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHOT1Q8IXI2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHOT1Q8IXI2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHOT1Q8IXI2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHOT1Q8IXI2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHOT1Q8IXI2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHOT1Q8IXI2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHOT1Q8IXI2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHOT1Q8IXI2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHOT1Q8IXI2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHOT1Q8IXI2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHOT1Q8IXI2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHOT1Q8IXI2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms