Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUX4

APOBEC3F, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3F, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3FQ8IUX4 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
APOBEC3FQ8IUX4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
APOBEC3FQ8IUX4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
APOBEC3FQ8IUX4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
APOBEC3FQ8IUX4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
APOBEC3FQ8IUX4 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
APOBEC3FQ8IUX4 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
APOBEC3FQ8IUX4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
APOBEC3FQ8IUX4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
APOBEC3FQ8IUX4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
APOBEC3FQ8IUX4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
APOBEC3FQ8IUX4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
APOBEC3FQ8IUX4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
APOBEC3FQ8IUX4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
APOBEC3FQ8IUX4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
APOBEC3FQ8IUX4 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
APOBEC3FQ8IUX4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
APOBEC3FQ8IUX4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
APOBEC3FQ8IUX4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
APOBEC3FQ8IUX4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
APOBEC3FQ8IUX4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
APOBEC3FQ8IUX4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
APOBEC3FQ8IUX4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
APOBEC3FQ8IUX4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
APOBEC3FQ8IUX4 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
APOBEC3FQ8IUX4 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
APOBEC3FQ8IUX4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
APOBEC3FQ8IUX4 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
APOBEC3FQ8IUX4 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
APOBEC3FQ8IUX4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
APOBEC3FQ8IUX4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
APOBEC3FQ8IUX4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
APOBEC3FQ8IUX4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
APOBEC3FQ8IUX4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
APOBEC3FQ8IUX4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
APOBEC3FQ8IUX4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
APOBEC3FQ8IUX4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
APOBEC3FQ8IUX4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
APOBEC3FQ8IUX4 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
APOBEC3FQ8IUX4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
APOBEC3FQ8IUX4 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
APOBEC3FQ8IUX4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
APOBEC3FQ8IUX4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
APOBEC3FQ8IUX4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
APOBEC3FQ8IUX4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
APOBEC3FQ8IUX4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
APOBEC3FQ8IUX4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
APOBEC3FQ8IUX4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
APOBEC3FQ8IUX4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
APOBEC3FQ8IUX4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
APOBEC3FQ8IUX4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
APOBEC3FQ8IUX4 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
APOBEC3FQ8IUX4 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
APOBEC3FQ8IUX4 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
APOBEC3FQ8IUX4 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
APOBEC3FQ8IUX4 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
APOBEC3FQ8IUX4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
APOBEC3FQ8IUX4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
APOBEC3FQ8IUX4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
APOBEC3FQ8IUX4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
APOBEC3FQ8IUX4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
APOBEC3FQ8IUX4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
APOBEC3FQ8IUX4 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
APOBEC3FQ8IUX4 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
APOBEC3FQ8IUX4 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
APOBEC3FQ8IUX4 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
APOBEC3FQ8IUX4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
APOBEC3FQ8IUX4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
APOBEC3FQ8IUX4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
APOBEC3FQ8IUX4 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
APOBEC3FQ8IUX4 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
APOBEC3FQ8IUX4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
APOBEC3FQ8IUX4 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
APOBEC3FQ8IUX4 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
APOBEC3FQ8IUX4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
APOBEC3FQ8IUX4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
APOBEC3FQ8IUX4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
APOBEC3FQ8IUX4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
APOBEC3FQ8IUX4 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
APOBEC3FQ8IUX4 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
APOBEC3FQ8IUX4 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
APOBEC3FQ8IUX4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
APOBEC3FQ8IUX4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
APOBEC3FQ8IUX4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
APOBEC3FQ8IUX4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
APOBEC3FQ8IUX4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
APOBEC3FQ8IUX4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
APOBEC3FQ8IUX4 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
APOBEC3FQ8IUX4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
APOBEC3FQ8IUX4 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
APOBEC3FQ8IUX4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
APOBEC3FQ8IUX4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
APOBEC3FQ8IUX4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
APOBEC3FQ8IUX4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
APOBEC3FQ8IUX4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
APOBEC3FQ8IUX4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
APOBEC3FQ8IUX4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
APOBEC3FQ8IUX4 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
APOBEC3FQ8IUX4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
APOBEC3FQ8IUX4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms