Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC84Q86UT8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC84Q86UT8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC84Q86UT8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC84Q86UT8 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC84Q86UT8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC84Q86UT8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC84Q86UT8 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC84Q86UT8 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC84Q86UT8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC84Q86UT8 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC84Q86UT8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC84Q86UT8 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC84Q86UT8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC84Q86UT8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC84Q86UT8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC84Q86UT8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC84Q86UT8 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC84Q86UT8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC84Q86UT8 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC84Q86UT8 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC84Q86UT8 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC84Q86UT8 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC84Q86UT8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC84Q86UT8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC84Q86UT8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC84Q86UT8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC84Q86UT8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC84Q86UT8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC84Q86UT8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC84Q86UT8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC84Q86UT8 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC84Q86UT8 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC84Q86UT8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC84Q86UT8 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC84Q86UT8 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC84Q86UT8 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC84Q86UT8 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC84Q86UT8 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC84Q86UT8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC84Q86UT8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC84Q86UT8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC84Q86UT8 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC84Q86UT8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC84Q86UT8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC84Q86UT8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC84Q86UT8 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC84Q86UT8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC84Q86UT8 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC84Q86UT8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC84Q86UT8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC84Q86UT8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC84Q86UT8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC84Q86UT8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC84Q86UT8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC84Q86UT8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC84Q86UT8 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC84Q86UT8 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC84Q86UT8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC84Q86UT8 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC84Q86UT8 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC84Q86UT8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC84Q86UT8 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC84Q86UT8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC84Q86UT8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC84Q86UT8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC84Q86UT8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC84Q86UT8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
CCDC84Q86UT8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
CCDC84Q86UT8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
CCDC84Q86UT8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC84Q86UT8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC84Q86UT8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC84Q86UT8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC84Q86UT8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC84Q86UT8 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC84Q86UT8 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC84Q86UT8 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC84Q86UT8 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC84Q86UT8 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC84Q86UT8 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC84Q86UT8 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC84Q86UT8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC84Q86UT8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC84Q86UT8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC84Q86UT8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC84Q86UT8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC84Q86UT8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC84Q86UT8 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC84Q86UT8 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC84Q86UT8 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC84Q86UT8 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC84Q86UT8 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC84Q86UT8 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC84Q86UT8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC84Q86UT8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC84Q86UT8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC84Q86UT8 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC84Q86UT8 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC84Q86UT8 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms