Protein–RNA interactions for Protein: Q86UA6

RPAIN, RPA-interacting protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAINQ86UA6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPAINQ86UA6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPAINQ86UA6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPAINQ86UA6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPAINQ86UA6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPAINQ86UA6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPAINQ86UA6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPAINQ86UA6 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPAINQ86UA6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPAINQ86UA6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPAINQ86UA6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPAINQ86UA6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPAINQ86UA6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPAINQ86UA6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPAINQ86UA6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPAINQ86UA6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPAINQ86UA6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPAINQ86UA6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPAINQ86UA6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPAINQ86UA6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPAINQ86UA6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPAINQ86UA6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RPAINQ86UA6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
RPAINQ86UA6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RPAINQ86UA6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPAINQ86UA6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPAINQ86UA6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPAINQ86UA6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPAINQ86UA6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPAINQ86UA6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPAINQ86UA6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPAINQ86UA6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPAINQ86UA6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPAINQ86UA6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPAINQ86UA6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPAINQ86UA6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPAINQ86UA6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPAINQ86UA6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPAINQ86UA6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPAINQ86UA6 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPAINQ86UA6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPAINQ86UA6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPAINQ86UA6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPAINQ86UA6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPAINQ86UA6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPAINQ86UA6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPAINQ86UA6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPAINQ86UA6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPAINQ86UA6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPAINQ86UA6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPAINQ86UA6 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPAINQ86UA6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RPAINQ86UA6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPAINQ86UA6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPAINQ86UA6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPAINQ86UA6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPAINQ86UA6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPAINQ86UA6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPAINQ86UA6 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPAINQ86UA6 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPAINQ86UA6 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RPAINQ86UA6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPAINQ86UA6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPAINQ86UA6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPAINQ86UA6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPAINQ86UA6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPAINQ86UA6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPAINQ86UA6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RPAINQ86UA6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPAINQ86UA6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPAINQ86UA6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPAINQ86UA6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPAINQ86UA6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RPAINQ86UA6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPAINQ86UA6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPAINQ86UA6 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPAINQ86UA6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPAINQ86UA6 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPAINQ86UA6 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPAINQ86UA6 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPAINQ86UA6 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPAINQ86UA6 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPAINQ86UA6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPAINQ86UA6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPAINQ86UA6 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPAINQ86UA6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPAINQ86UA6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPAINQ86UA6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPAINQ86UA6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPAINQ86UA6 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPAINQ86UA6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPAINQ86UA6 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPAINQ86UA6 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPAINQ86UA6 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPAINQ86UA6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPAINQ86UA6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPAINQ86UA6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPAINQ86UA6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPAINQ86UA6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPAINQ86UA6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
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