Protein–RNA interactions for Protein: Q86U02

LINC00596, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00596, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00596Q86U02 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00596Q86U02 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00596Q86U02 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00596Q86U02 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00596Q86U02 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00596Q86U02 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00596Q86U02 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00596Q86U02 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00596Q86U02 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00596Q86U02 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00596Q86U02 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00596Q86U02 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00596Q86U02 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00596Q86U02 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00596Q86U02 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00596Q86U02 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00596Q86U02 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00596Q86U02 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00596Q86U02 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00596Q86U02 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00596Q86U02 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00596Q86U02 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00596Q86U02 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00596Q86U02 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00596Q86U02 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00596Q86U02 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00596Q86U02 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00596Q86U02 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00596Q86U02 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00596Q86U02 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00596Q86U02 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00596Q86U02 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00596Q86U02 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00596Q86U02 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00596Q86U02 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00596Q86U02 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00596Q86U02 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00596Q86U02 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00596Q86U02 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00596Q86U02 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00596Q86U02 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00596Q86U02 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00596Q86U02 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00596Q86U02 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00596Q86U02 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00596Q86U02 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00596Q86U02 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00596Q86U02 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00596Q86U02 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00596Q86U02 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00596Q86U02 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00596Q86U02 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00596Q86U02 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00596Q86U02 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00596Q86U02 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00596Q86U02 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00596Q86U02 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00596Q86U02 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00596Q86U02 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00596Q86U02 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00596Q86U02 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00596Q86U02 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00596Q86U02 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00596Q86U02 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00596Q86U02 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00596Q86U02 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
LINC00596Q86U02 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00596Q86U02 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00596Q86U02 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00596Q86U02 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00596Q86U02 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00596Q86U02 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00596Q86U02 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00596Q86U02 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00596Q86U02 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00596Q86U02 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00596Q86U02 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00596Q86U02 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00596Q86U02 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00596Q86U02 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00596Q86U02 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00596Q86U02 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00596Q86U02 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00596Q86U02 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00596Q86U02 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00596Q86U02 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00596Q86U02 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00596Q86U02 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00596Q86U02 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00596Q86U02 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00596Q86U02 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00596Q86U02 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00596Q86U02 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00596Q86U02 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00596Q86U02 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00596Q86U02 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00596Q86U02 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00596Q86U02 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00596Q86U02 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00596Q86U02 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms