Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7G1

CLNK, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNKQ7Z7G1 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLNKQ7Z7G1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLNKQ7Z7G1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLNKQ7Z7G1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CLNKQ7Z7G1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CLNKQ7Z7G1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLNKQ7Z7G1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLNKQ7Z7G1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLNKQ7Z7G1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CLNKQ7Z7G1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLNKQ7Z7G1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLNKQ7Z7G1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLNKQ7Z7G1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLNKQ7Z7G1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLNKQ7Z7G1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLNKQ7Z7G1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLNKQ7Z7G1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLNKQ7Z7G1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLNKQ7Z7G1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLNKQ7Z7G1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLNKQ7Z7G1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLNKQ7Z7G1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLNKQ7Z7G1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLNKQ7Z7G1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLNKQ7Z7G1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLNKQ7Z7G1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLNKQ7Z7G1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLNKQ7Z7G1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLNKQ7Z7G1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLNKQ7Z7G1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLNKQ7Z7G1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLNKQ7Z7G1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLNKQ7Z7G1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLNKQ7Z7G1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLNKQ7Z7G1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLNKQ7Z7G1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLNKQ7Z7G1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CLNKQ7Z7G1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLNKQ7Z7G1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CLNKQ7Z7G1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLNKQ7Z7G1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLNKQ7Z7G1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLNKQ7Z7G1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLNKQ7Z7G1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLNKQ7Z7G1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLNKQ7Z7G1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLNKQ7Z7G1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLNKQ7Z7G1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CLNKQ7Z7G1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLNKQ7Z7G1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CLNKQ7Z7G1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CLNKQ7Z7G1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CLNKQ7Z7G1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CLNKQ7Z7G1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLNKQ7Z7G1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLNKQ7Z7G1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CLNKQ7Z7G1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLNKQ7Z7G1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLNKQ7Z7G1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLNKQ7Z7G1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLNKQ7Z7G1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CLNKQ7Z7G1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLNKQ7Z7G1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLNKQ7Z7G1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLNKQ7Z7G1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLNKQ7Z7G1 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLNKQ7Z7G1 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLNKQ7Z7G1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLNKQ7Z7G1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLNKQ7Z7G1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLNKQ7Z7G1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLNKQ7Z7G1 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLNKQ7Z7G1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLNKQ7Z7G1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLNKQ7Z7G1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLNKQ7Z7G1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLNKQ7Z7G1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLNKQ7Z7G1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLNKQ7Z7G1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLNKQ7Z7G1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLNKQ7Z7G1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLNKQ7Z7G1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLNKQ7Z7G1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLNKQ7Z7G1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLNKQ7Z7G1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLNKQ7Z7G1 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLNKQ7Z7G1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CLNKQ7Z7G1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLNKQ7Z7G1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLNKQ7Z7G1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLNKQ7Z7G1 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLNKQ7Z7G1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLNKQ7Z7G1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLNKQ7Z7G1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLNKQ7Z7G1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLNKQ7Z7G1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLNKQ7Z7G1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLNKQ7Z7G1 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLNKQ7Z7G1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLNKQ7Z7G1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms