Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATG9AQ7Z3C6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATG9AQ7Z3C6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATG9AQ7Z3C6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
ATG9AQ7Z3C6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
ATG9AQ7Z3C6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATG9AQ7Z3C6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ATG9AQ7Z3C6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATG9AQ7Z3C6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ATG9AQ7Z3C6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATG9AQ7Z3C6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ATG9AQ7Z3C6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ATG9AQ7Z3C6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATG9AQ7Z3C6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATG9AQ7Z3C6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATG9AQ7Z3C6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATG9AQ7Z3C6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATG9AQ7Z3C6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATG9AQ7Z3C6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATG9AQ7Z3C6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATG9AQ7Z3C6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATG9AQ7Z3C6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATG9AQ7Z3C6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATG9AQ7Z3C6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATG9AQ7Z3C6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATG9AQ7Z3C6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATG9AQ7Z3C6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATG9AQ7Z3C6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATG9AQ7Z3C6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATG9AQ7Z3C6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATG9AQ7Z3C6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ATG9AQ7Z3C6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATG9AQ7Z3C6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATG9AQ7Z3C6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATG9AQ7Z3C6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATG9AQ7Z3C6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATG9AQ7Z3C6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATG9AQ7Z3C6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ATG9AQ7Z3C6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATG9AQ7Z3C6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATG9AQ7Z3C6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATG9AQ7Z3C6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATG9AQ7Z3C6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATG9AQ7Z3C6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ATG9AQ7Z3C6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATG9AQ7Z3C6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ATG9AQ7Z3C6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATG9AQ7Z3C6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATG9AQ7Z3C6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATG9AQ7Z3C6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATG9AQ7Z3C6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATG9AQ7Z3C6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATG9AQ7Z3C6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATG9AQ7Z3C6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
ATG9AQ7Z3C6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
ATG9AQ7Z3C6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATG9AQ7Z3C6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATG9AQ7Z3C6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATG9AQ7Z3C6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATG9AQ7Z3C6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATG9AQ7Z3C6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATG9AQ7Z3C6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATG9AQ7Z3C6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATG9AQ7Z3C6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATG9AQ7Z3C6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATG9AQ7Z3C6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATG9AQ7Z3C6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ATG9AQ7Z3C6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATG9AQ7Z3C6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATG9AQ7Z3C6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATG9AQ7Z3C6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATG9AQ7Z3C6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATG9AQ7Z3C6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATG9AQ7Z3C6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ATG9AQ7Z3C6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATG9AQ7Z3C6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ATG9AQ7Z3C6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ATG9AQ7Z3C6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ATG9AQ7Z3C6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ATG9AQ7Z3C6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ATG9AQ7Z3C6 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ATG9AQ7Z3C6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ATG9AQ7Z3C6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATG9AQ7Z3C6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATG9AQ7Z3C6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATG9AQ7Z3C6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATG9AQ7Z3C6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATG9AQ7Z3C6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATG9AQ7Z3C6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATG9AQ7Z3C6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
ATG9AQ7Z3C6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
ATG9AQ7Z3C6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATG9AQ7Z3C6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATG9AQ7Z3C6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATG9AQ7Z3C6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATG9AQ7Z3C6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATG9AQ7Z3C6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATG9AQ7Z3C6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATG9AQ7Z3C6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATG9AQ7Z3C6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms