Protein–RNA interactions for Protein: Q71UI9

H2AFV, Histone H2A.V, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFVQ71UI9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
H2AFVQ71UI9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
H2AFVQ71UI9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
H2AFVQ71UI9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
H2AFVQ71UI9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
H2AFVQ71UI9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
H2AFVQ71UI9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
H2AFVQ71UI9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
H2AFVQ71UI9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
H2AFVQ71UI9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
H2AFVQ71UI9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
H2AFVQ71UI9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
H2AFVQ71UI9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
H2AFVQ71UI9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
H2AFVQ71UI9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
H2AFVQ71UI9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
H2AFVQ71UI9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
H2AFVQ71UI9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
H2AFVQ71UI9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
H2AFVQ71UI9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
H2AFVQ71UI9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
H2AFVQ71UI9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
H2AFVQ71UI9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
H2AFVQ71UI9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
H2AFVQ71UI9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
H2AFVQ71UI9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
H2AFVQ71UI9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
H2AFVQ71UI9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
H2AFVQ71UI9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
H2AFVQ71UI9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
H2AFVQ71UI9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
H2AFVQ71UI9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
H2AFVQ71UI9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
H2AFVQ71UI9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
H2AFVQ71UI9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
H2AFVQ71UI9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
H2AFVQ71UI9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
H2AFVQ71UI9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
H2AFVQ71UI9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
H2AFVQ71UI9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
H2AFVQ71UI9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
H2AFVQ71UI9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
H2AFVQ71UI9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
H2AFVQ71UI9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
H2AFVQ71UI9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
H2AFVQ71UI9 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
H2AFVQ71UI9 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
H2AFVQ71UI9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
H2AFVQ71UI9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
H2AFVQ71UI9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
H2AFVQ71UI9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
H2AFVQ71UI9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
H2AFVQ71UI9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
H2AFVQ71UI9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
H2AFVQ71UI9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
H2AFVQ71UI9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
H2AFVQ71UI9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
H2AFVQ71UI9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
H2AFVQ71UI9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
H2AFVQ71UI9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
H2AFVQ71UI9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
H2AFVQ71UI9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
H2AFVQ71UI9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
H2AFVQ71UI9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
H2AFVQ71UI9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
H2AFVQ71UI9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
H2AFVQ71UI9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
H2AFVQ71UI9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
H2AFVQ71UI9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
H2AFVQ71UI9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
H2AFVQ71UI9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
H2AFVQ71UI9 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
H2AFVQ71UI9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
H2AFVQ71UI9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
H2AFVQ71UI9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
H2AFVQ71UI9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
H2AFVQ71UI9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
H2AFVQ71UI9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
H2AFVQ71UI9 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
H2AFVQ71UI9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
H2AFVQ71UI9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
H2AFVQ71UI9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
H2AFVQ71UI9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
H2AFVQ71UI9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
H2AFVQ71UI9 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
H2AFVQ71UI9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
H2AFVQ71UI9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
H2AFVQ71UI9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
H2AFVQ71UI9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
H2AFVQ71UI9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
H2AFVQ71UI9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
H2AFVQ71UI9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
H2AFVQ71UI9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
H2AFVQ71UI9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
H2AFVQ71UI9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
H2AFVQ71UI9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
H2AFVQ71UI9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
H2AFVQ71UI9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
H2AFVQ71UI9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
H2AFVQ71UI9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms