Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SMIM5Q71RC9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMIM5Q71RC9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMIM5Q71RC9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMIM5Q71RC9 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMIM5Q71RC9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMIM5Q71RC9 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SMIM5Q71RC9 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMIM5Q71RC9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMIM5Q71RC9 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMIM5Q71RC9 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMIM5Q71RC9 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SMIM5Q71RC9 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SMIM5Q71RC9 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMIM5Q71RC9 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMIM5Q71RC9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMIM5Q71RC9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMIM5Q71RC9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMIM5Q71RC9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMIM5Q71RC9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMIM5Q71RC9 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMIM5Q71RC9 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMIM5Q71RC9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMIM5Q71RC9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMIM5Q71RC9 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMIM5Q71RC9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMIM5Q71RC9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMIM5Q71RC9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
SMIM5Q71RC9 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMIM5Q71RC9 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMIM5Q71RC9 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMIM5Q71RC9 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SMIM5Q71RC9 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SMIM5Q71RC9 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMIM5Q71RC9 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMIM5Q71RC9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMIM5Q71RC9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMIM5Q71RC9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMIM5Q71RC9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SMIM5Q71RC9 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SMIM5Q71RC9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SMIM5Q71RC9 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SMIM5Q71RC9 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SMIM5Q71RC9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SMIM5Q71RC9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SMIM5Q71RC9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SMIM5Q71RC9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SMIM5Q71RC9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMIM5Q71RC9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMIM5Q71RC9 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMIM5Q71RC9 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMIM5Q71RC9 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMIM5Q71RC9 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMIM5Q71RC9 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMIM5Q71RC9 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMIM5Q71RC9 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMIM5Q71RC9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SMIM5Q71RC9 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMIM5Q71RC9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMIM5Q71RC9 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMIM5Q71RC9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMIM5Q71RC9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMIM5Q71RC9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMIM5Q71RC9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMIM5Q71RC9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMIM5Q71RC9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMIM5Q71RC9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMIM5Q71RC9 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMIM5Q71RC9 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMIM5Q71RC9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMIM5Q71RC9 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SMIM5Q71RC9 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMIM5Q71RC9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMIM5Q71RC9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMIM5Q71RC9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMIM5Q71RC9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SMIM5Q71RC9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SMIM5Q71RC9 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMIM5Q71RC9 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMIM5Q71RC9 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SMIM5Q71RC9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMIM5Q71RC9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMIM5Q71RC9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMIM5Q71RC9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMIM5Q71RC9 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMIM5Q71RC9 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMIM5Q71RC9 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMIM5Q71RC9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMIM5Q71RC9 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SMIM5Q71RC9 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SMIM5Q71RC9 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
SMIM5Q71RC9 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
SMIM5Q71RC9 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
SMIM5Q71RC9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SMIM5Q71RC9 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SMIM5Q71RC9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMIM5Q71RC9 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMIM5Q71RC9 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMIM5Q71RC9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SMIM5Q71RC9 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms