Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q71RC1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Q71RC1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Q71RC1 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q71RC1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q71RC1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q71RC1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q71RC1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q71RC1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q71RC1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q71RC1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q71RC1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q71RC1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q71RC1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q71RC1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q71RC1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q71RC1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q71RC1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q71RC1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q71RC1 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q71RC1 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q71RC1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q71RC1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q71RC1 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Q71RC1 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q71RC1 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q71RC1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q71RC1 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q71RC1 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q71RC1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q71RC1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q71RC1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q71RC1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Q71RC1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q71RC1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q71RC1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q71RC1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q71RC1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q71RC1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q71RC1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q71RC1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q71RC1 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q71RC1 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q71RC1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q71RC1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q71RC1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q71RC1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q71RC1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q71RC1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q71RC1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q71RC1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q71RC1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q71RC1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q71RC1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q71RC1 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q71RC1 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q71RC1 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q71RC1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Q71RC1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q71RC1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q71RC1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Q71RC1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Q71RC1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Q71RC1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q71RC1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q71RC1 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q71RC1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q71RC1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q71RC1 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Q71RC1 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Q71RC1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Q71RC1 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q71RC1 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q71RC1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Q71RC1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q71RC1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q71RC1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q71RC1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q71RC1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q71RC1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q71RC1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q71RC1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q71RC1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q71RC1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q71RC1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q71RC1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q71RC1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q71RC1 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q71RC1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q71RC1 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q71RC1 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Q71RC1 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q71RC1 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q71RC1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q71RC1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q71RC1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q71RC1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q71RC1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q71RC1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q71RC1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms