Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZR52

ZNF493, Zinc finger protein 493, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF493Q6ZR52 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF493Q6ZR52 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF493Q6ZR52 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF493Q6ZR52 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF493Q6ZR52 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF493Q6ZR52 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF493Q6ZR52 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF493Q6ZR52 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF493Q6ZR52 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF493Q6ZR52 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF493Q6ZR52 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF493Q6ZR52 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF493Q6ZR52 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF493Q6ZR52 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF493Q6ZR52 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF493Q6ZR52 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF493Q6ZR52 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF493Q6ZR52 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF493Q6ZR52 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF493Q6ZR52 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF493Q6ZR52 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF493Q6ZR52 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF493Q6ZR52 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF493Q6ZR52 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF493Q6ZR52 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF493Q6ZR52 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF493Q6ZR52 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF493Q6ZR52 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF493Q6ZR52 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF493Q6ZR52 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF493Q6ZR52 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF493Q6ZR52 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF493Q6ZR52 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF493Q6ZR52 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF493Q6ZR52 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF493Q6ZR52 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF493Q6ZR52 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF493Q6ZR52 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF493Q6ZR52 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF493Q6ZR52 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF493Q6ZR52 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF493Q6ZR52 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF493Q6ZR52 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF493Q6ZR52 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF493Q6ZR52 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF493Q6ZR52 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF493Q6ZR52 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF493Q6ZR52 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF493Q6ZR52 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF493Q6ZR52 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF493Q6ZR52 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF493Q6ZR52 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF493Q6ZR52 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF493Q6ZR52 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF493Q6ZR52 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF493Q6ZR52 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF493Q6ZR52 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF493Q6ZR52 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF493Q6ZR52 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF493Q6ZR52 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF493Q6ZR52 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF493Q6ZR52 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF493Q6ZR52 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF493Q6ZR52 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF493Q6ZR52 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF493Q6ZR52 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.7 ms