Protein–RNA interactions for Protein: Q6YHK3

CD109, CD109 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD109Q6YHK3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CD109Q6YHK3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CD109Q6YHK3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CD109Q6YHK3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CD109Q6YHK3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CD109Q6YHK3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CD109Q6YHK3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CD109Q6YHK3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CD109Q6YHK3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CD109Q6YHK3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CD109Q6YHK3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CD109Q6YHK3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CD109Q6YHK3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CD109Q6YHK3 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CD109Q6YHK3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CD109Q6YHK3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CD109Q6YHK3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CD109Q6YHK3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CD109Q6YHK3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
CD109Q6YHK3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CD109Q6YHK3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CD109Q6YHK3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CD109Q6YHK3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CD109Q6YHK3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
CD109Q6YHK3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CD109Q6YHK3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CD109Q6YHK3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
CD109Q6YHK3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CD109Q6YHK3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CD109Q6YHK3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CD109Q6YHK3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
CD109Q6YHK3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CD109Q6YHK3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CD109Q6YHK3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CD109Q6YHK3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CD109Q6YHK3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CD109Q6YHK3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CD109Q6YHK3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CD109Q6YHK3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CD109Q6YHK3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CD109Q6YHK3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CD109Q6YHK3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CD109Q6YHK3 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CD109Q6YHK3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CD109Q6YHK3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CD109Q6YHK3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CD109Q6YHK3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CD109Q6YHK3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CD109Q6YHK3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CD109Q6YHK3 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CD109Q6YHK3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
CD109Q6YHK3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CD109Q6YHK3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CD109Q6YHK3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CD109Q6YHK3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CD109Q6YHK3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CD109Q6YHK3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CD109Q6YHK3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CD109Q6YHK3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CD109Q6YHK3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CD109Q6YHK3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CD109Q6YHK3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CD109Q6YHK3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CD109Q6YHK3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CD109Q6YHK3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CD109Q6YHK3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CD109Q6YHK3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CD109Q6YHK3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CD109Q6YHK3 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CD109Q6YHK3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
CD109Q6YHK3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CD109Q6YHK3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CD109Q6YHK3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CD109Q6YHK3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CD109Q6YHK3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CD109Q6YHK3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CD109Q6YHK3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CD109Q6YHK3 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CD109Q6YHK3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CD109Q6YHK3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
CD109Q6YHK3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CD109Q6YHK3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC33.82■■■■□ 3
CD109Q6YHK3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CD109Q6YHK3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
CD109Q6YHK3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CD109Q6YHK3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CD109Q6YHK3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
CD109Q6YHK3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CD109Q6YHK3 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
CD109Q6YHK3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CD109Q6YHK3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CD109Q6YHK3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC33.81■■■■□ 3
CD109Q6YHK3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
CD109Q6YHK3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
CD109Q6YHK3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CD109Q6YHK3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CD109Q6YHK3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
CD109Q6YHK3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
CD109Q6YHK3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CD109Q6YHK3 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC33.8■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms