Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Z2

PKN3, Serine/threonine-protein kinase N3, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN3Q6P5Z2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PKN3Q6P5Z2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PKN3Q6P5Z2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PKN3Q6P5Z2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PKN3Q6P5Z2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PKN3Q6P5Z2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PKN3Q6P5Z2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PKN3Q6P5Z2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PKN3Q6P5Z2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PKN3Q6P5Z2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PKN3Q6P5Z2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PKN3Q6P5Z2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PKN3Q6P5Z2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PKN3Q6P5Z2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PKN3Q6P5Z2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PKN3Q6P5Z2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PKN3Q6P5Z2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PKN3Q6P5Z2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PKN3Q6P5Z2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKN3Q6P5Z2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKN3Q6P5Z2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKN3Q6P5Z2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKN3Q6P5Z2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKN3Q6P5Z2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKN3Q6P5Z2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKN3Q6P5Z2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKN3Q6P5Z2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKN3Q6P5Z2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKN3Q6P5Z2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKN3Q6P5Z2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKN3Q6P5Z2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKN3Q6P5Z2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKN3Q6P5Z2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKN3Q6P5Z2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKN3Q6P5Z2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKN3Q6P5Z2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKN3Q6P5Z2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKN3Q6P5Z2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKN3Q6P5Z2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKN3Q6P5Z2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKN3Q6P5Z2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKN3Q6P5Z2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKN3Q6P5Z2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKN3Q6P5Z2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKN3Q6P5Z2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKN3Q6P5Z2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKN3Q6P5Z2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKN3Q6P5Z2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKN3Q6P5Z2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKN3Q6P5Z2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKN3Q6P5Z2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKN3Q6P5Z2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKN3Q6P5Z2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKN3Q6P5Z2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKN3Q6P5Z2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKN3Q6P5Z2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKN3Q6P5Z2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKN3Q6P5Z2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKN3Q6P5Z2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKN3Q6P5Z2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKN3Q6P5Z2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKN3Q6P5Z2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKN3Q6P5Z2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKN3Q6P5Z2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKN3Q6P5Z2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKN3Q6P5Z2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKN3Q6P5Z2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKN3Q6P5Z2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PKN3Q6P5Z2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKN3Q6P5Z2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKN3Q6P5Z2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKN3Q6P5Z2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKN3Q6P5Z2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKN3Q6P5Z2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKN3Q6P5Z2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKN3Q6P5Z2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKN3Q6P5Z2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKN3Q6P5Z2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKN3Q6P5Z2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKN3Q6P5Z2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKN3Q6P5Z2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKN3Q6P5Z2 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PKN3Q6P5Z2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKN3Q6P5Z2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKN3Q6P5Z2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKN3Q6P5Z2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKN3Q6P5Z2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKN3Q6P5Z2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKN3Q6P5Z2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKN3Q6P5Z2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PKN3Q6P5Z2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PKN3Q6P5Z2 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PKN3Q6P5Z2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PKN3Q6P5Z2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PKN3Q6P5Z2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PKN3Q6P5Z2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PKN3Q6P5Z2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PKN3Q6P5Z2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PKN3Q6P5Z2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKN3Q6P5Z2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms