Protein–RNA interactions for Protein: Q6P597

KLC3, Kinesin light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLC3Q6P597 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLC3Q6P597 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLC3Q6P597 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLC3Q6P597 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLC3Q6P597 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLC3Q6P597 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLC3Q6P597 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLC3Q6P597 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLC3Q6P597 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLC3Q6P597 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLC3Q6P597 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLC3Q6P597 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLC3Q6P597 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
KLC3Q6P597 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
KLC3Q6P597 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLC3Q6P597 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLC3Q6P597 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
KLC3Q6P597 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLC3Q6P597 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLC3Q6P597 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLC3Q6P597 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLC3Q6P597 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLC3Q6P597 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLC3Q6P597 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLC3Q6P597 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLC3Q6P597 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLC3Q6P597 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLC3Q6P597 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLC3Q6P597 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLC3Q6P597 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLC3Q6P597 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLC3Q6P597 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLC3Q6P597 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLC3Q6P597 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLC3Q6P597 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLC3Q6P597 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLC3Q6P597 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
KLC3Q6P597 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLC3Q6P597 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLC3Q6P597 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLC3Q6P597 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLC3Q6P597 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
KLC3Q6P597 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLC3Q6P597 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLC3Q6P597 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLC3Q6P597 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLC3Q6P597 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLC3Q6P597 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLC3Q6P597 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLC3Q6P597 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLC3Q6P597 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLC3Q6P597 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLC3Q6P597 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLC3Q6P597 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLC3Q6P597 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLC3Q6P597 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLC3Q6P597 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLC3Q6P597 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLC3Q6P597 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLC3Q6P597 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLC3Q6P597 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLC3Q6P597 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
KLC3Q6P597 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLC3Q6P597 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLC3Q6P597 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLC3Q6P597 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLC3Q6P597 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLC3Q6P597 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLC3Q6P597 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLC3Q6P597 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
KLC3Q6P597 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLC3Q6P597 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLC3Q6P597 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLC3Q6P597 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLC3Q6P597 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLC3Q6P597 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLC3Q6P597 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLC3Q6P597 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLC3Q6P597 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLC3Q6P597 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLC3Q6P597 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLC3Q6P597 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLC3Q6P597 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLC3Q6P597 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
KLC3Q6P597 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
KLC3Q6P597 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLC3Q6P597 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
KLC3Q6P597 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLC3Q6P597 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLC3Q6P597 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLC3Q6P597 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLC3Q6P597 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLC3Q6P597 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLC3Q6P597 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLC3Q6P597 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLC3Q6P597 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLC3Q6P597 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLC3Q6P597 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLC3Q6P597 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLC3Q6P597 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms