Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LETMD1Q6P1Q0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LETMD1Q6P1Q0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LETMD1Q6P1Q0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LETMD1Q6P1Q0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LETMD1Q6P1Q0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LETMD1Q6P1Q0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LETMD1Q6P1Q0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LETMD1Q6P1Q0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
LETMD1Q6P1Q0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LETMD1Q6P1Q0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LETMD1Q6P1Q0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LETMD1Q6P1Q0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LETMD1Q6P1Q0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LETMD1Q6P1Q0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LETMD1Q6P1Q0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LETMD1Q6P1Q0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LETMD1Q6P1Q0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LETMD1Q6P1Q0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LETMD1Q6P1Q0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LETMD1Q6P1Q0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LETMD1Q6P1Q0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LETMD1Q6P1Q0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LETMD1Q6P1Q0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LETMD1Q6P1Q0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LETMD1Q6P1Q0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
LETMD1Q6P1Q0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LETMD1Q6P1Q0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LETMD1Q6P1Q0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LETMD1Q6P1Q0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LETMD1Q6P1Q0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LETMD1Q6P1Q0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LETMD1Q6P1Q0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LETMD1Q6P1Q0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LETMD1Q6P1Q0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LETMD1Q6P1Q0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LETMD1Q6P1Q0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LETMD1Q6P1Q0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LETMD1Q6P1Q0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LETMD1Q6P1Q0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LETMD1Q6P1Q0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LETMD1Q6P1Q0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LETMD1Q6P1Q0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LETMD1Q6P1Q0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LETMD1Q6P1Q0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LETMD1Q6P1Q0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LETMD1Q6P1Q0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LETMD1Q6P1Q0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LETMD1Q6P1Q0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LETMD1Q6P1Q0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LETMD1Q6P1Q0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LETMD1Q6P1Q0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
LETMD1Q6P1Q0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LETMD1Q6P1Q0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LETMD1Q6P1Q0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LETMD1Q6P1Q0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LETMD1Q6P1Q0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LETMD1Q6P1Q0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LETMD1Q6P1Q0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LETMD1Q6P1Q0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LETMD1Q6P1Q0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
LETMD1Q6P1Q0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
LETMD1Q6P1Q0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
LETMD1Q6P1Q0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
LETMD1Q6P1Q0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LETMD1Q6P1Q0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LETMD1Q6P1Q0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LETMD1Q6P1Q0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LETMD1Q6P1Q0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LETMD1Q6P1Q0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LETMD1Q6P1Q0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LETMD1Q6P1Q0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LETMD1Q6P1Q0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LETMD1Q6P1Q0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LETMD1Q6P1Q0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LETMD1Q6P1Q0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LETMD1Q6P1Q0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LETMD1Q6P1Q0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LETMD1Q6P1Q0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LETMD1Q6P1Q0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LETMD1Q6P1Q0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LETMD1Q6P1Q0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LETMD1Q6P1Q0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LETMD1Q6P1Q0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LETMD1Q6P1Q0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LETMD1Q6P1Q0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LETMD1Q6P1Q0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LETMD1Q6P1Q0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
LETMD1Q6P1Q0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LETMD1Q6P1Q0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LETMD1Q6P1Q0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
LETMD1Q6P1Q0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LETMD1Q6P1Q0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LETMD1Q6P1Q0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
LETMD1Q6P1Q0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LETMD1Q6P1Q0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LETMD1Q6P1Q0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LETMD1Q6P1Q0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LETMD1Q6P1Q0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LETMD1Q6P1Q0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms