Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GARNL3Q5VVW2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GARNL3Q5VVW2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GARNL3Q5VVW2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GARNL3Q5VVW2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GARNL3Q5VVW2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GARNL3Q5VVW2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GARNL3Q5VVW2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GARNL3Q5VVW2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GARNL3Q5VVW2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GARNL3Q5VVW2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GARNL3Q5VVW2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GARNL3Q5VVW2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GARNL3Q5VVW2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
GARNL3Q5VVW2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
GARNL3Q5VVW2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GARNL3Q5VVW2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GARNL3Q5VVW2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GARNL3Q5VVW2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GARNL3Q5VVW2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
GARNL3Q5VVW2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GARNL3Q5VVW2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GARNL3Q5VVW2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GARNL3Q5VVW2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GARNL3Q5VVW2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GARNL3Q5VVW2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GARNL3Q5VVW2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GARNL3Q5VVW2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GARNL3Q5VVW2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
GARNL3Q5VVW2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GARNL3Q5VVW2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GARNL3Q5VVW2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GARNL3Q5VVW2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GARNL3Q5VVW2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
GARNL3Q5VVW2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GARNL3Q5VVW2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GARNL3Q5VVW2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GARNL3Q5VVW2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GARNL3Q5VVW2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GARNL3Q5VVW2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GARNL3Q5VVW2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GARNL3Q5VVW2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GARNL3Q5VVW2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GARNL3Q5VVW2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GARNL3Q5VVW2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GARNL3Q5VVW2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GARNL3Q5VVW2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GARNL3Q5VVW2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GARNL3Q5VVW2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GARNL3Q5VVW2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GARNL3Q5VVW2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
GARNL3Q5VVW2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
GARNL3Q5VVW2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GARNL3Q5VVW2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GARNL3Q5VVW2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GARNL3Q5VVW2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GARNL3Q5VVW2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GARNL3Q5VVW2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GARNL3Q5VVW2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GARNL3Q5VVW2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GARNL3Q5VVW2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GARNL3Q5VVW2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GARNL3Q5VVW2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GARNL3Q5VVW2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GARNL3Q5VVW2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GARNL3Q5VVW2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GARNL3Q5VVW2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GARNL3Q5VVW2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GARNL3Q5VVW2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GARNL3Q5VVW2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GARNL3Q5VVW2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GARNL3Q5VVW2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GARNL3Q5VVW2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
GARNL3Q5VVW2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GARNL3Q5VVW2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GARNL3Q5VVW2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GARNL3Q5VVW2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GARNL3Q5VVW2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GARNL3Q5VVW2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GARNL3Q5VVW2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GARNL3Q5VVW2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GARNL3Q5VVW2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GARNL3Q5VVW2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GARNL3Q5VVW2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GARNL3Q5VVW2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GARNL3Q5VVW2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GARNL3Q5VVW2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GARNL3Q5VVW2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GARNL3Q5VVW2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GARNL3Q5VVW2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GARNL3Q5VVW2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GARNL3Q5VVW2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GARNL3Q5VVW2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GARNL3Q5VVW2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GARNL3Q5VVW2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GARNL3Q5VVW2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GARNL3Q5VVW2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GARNL3Q5VVW2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GARNL3Q5VVW2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GARNL3Q5VVW2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 208.1 ms