Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT99

LRRC38, Leucine-rich repeat-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC38Q5VT99 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC38Q5VT99 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC38Q5VT99 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC38Q5VT99 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC38Q5VT99 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC38Q5VT99 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC38Q5VT99 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC38Q5VT99 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC38Q5VT99 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC38Q5VT99 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC38Q5VT99 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC38Q5VT99 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC38Q5VT99 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC38Q5VT99 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC38Q5VT99 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC38Q5VT99 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC38Q5VT99 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC38Q5VT99 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC38Q5VT99 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC38Q5VT99 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC38Q5VT99 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC38Q5VT99 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC38Q5VT99 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC38Q5VT99 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC38Q5VT99 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC38Q5VT99 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC38Q5VT99 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC38Q5VT99 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC38Q5VT99 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC38Q5VT99 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC38Q5VT99 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC38Q5VT99 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC38Q5VT99 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC38Q5VT99 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC38Q5VT99 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC38Q5VT99 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC38Q5VT99 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC38Q5VT99 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC38Q5VT99 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC38Q5VT99 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC38Q5VT99 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC38Q5VT99 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC38Q5VT99 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC38Q5VT99 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC38Q5VT99 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC38Q5VT99 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC38Q5VT99 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC38Q5VT99 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC38Q5VT99 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC38Q5VT99 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC38Q5VT99 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC38Q5VT99 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC38Q5VT99 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC38Q5VT99 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC38Q5VT99 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC38Q5VT99 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC38Q5VT99 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC38Q5VT99 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC38Q5VT99 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC38Q5VT99 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC38Q5VT99 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC38Q5VT99 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC38Q5VT99 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC38Q5VT99 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC38Q5VT99 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC38Q5VT99 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC38Q5VT99 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC38Q5VT99 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC38Q5VT99 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC38Q5VT99 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC38Q5VT99 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC38Q5VT99 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC38Q5VT99 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC38Q5VT99 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC38Q5VT99 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC38Q5VT99 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC38Q5VT99 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC38Q5VT99 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC38Q5VT99 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC38Q5VT99 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC38Q5VT99 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC38Q5VT99 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC38Q5VT99 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC38Q5VT99 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC38Q5VT99 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC38Q5VT99 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC38Q5VT99 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC38Q5VT99 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC38Q5VT99 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC38Q5VT99 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC38Q5VT99 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC38Q5VT99 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC38Q5VT99 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC38Q5VT99 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC38Q5VT99 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC38Q5VT99 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC38Q5VT99 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC38Q5VT99 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC38Q5VT99 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC38Q5VT99 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms