Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF58

IFFO2, Intermediate filament family orphan 2, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO2Q5TF58 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
IFFO2Q5TF58 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
IFFO2Q5TF58 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
IFFO2Q5TF58 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
IFFO2Q5TF58 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
IFFO2Q5TF58 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
IFFO2Q5TF58 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
IFFO2Q5TF58 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
IFFO2Q5TF58 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
IFFO2Q5TF58 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
IFFO2Q5TF58 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
IFFO2Q5TF58 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
IFFO2Q5TF58 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
IFFO2Q5TF58 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
IFFO2Q5TF58 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
IFFO2Q5TF58 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
IFFO2Q5TF58 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
IFFO2Q5TF58 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
IFFO2Q5TF58 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
IFFO2Q5TF58 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
IFFO2Q5TF58 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
IFFO2Q5TF58 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
IFFO2Q5TF58 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
IFFO2Q5TF58 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
IFFO2Q5TF58 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
IFFO2Q5TF58 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
IFFO2Q5TF58 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
IFFO2Q5TF58 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
IFFO2Q5TF58 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
IFFO2Q5TF58 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
IFFO2Q5TF58 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
IFFO2Q5TF58 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
IFFO2Q5TF58 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
IFFO2Q5TF58 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
IFFO2Q5TF58 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
IFFO2Q5TF58 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
IFFO2Q5TF58 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
IFFO2Q5TF58 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
IFFO2Q5TF58 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
IFFO2Q5TF58 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
IFFO2Q5TF58 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
IFFO2Q5TF58 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
IFFO2Q5TF58 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
IFFO2Q5TF58 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
IFFO2Q5TF58 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
IFFO2Q5TF58 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
IFFO2Q5TF58 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
IFFO2Q5TF58 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
IFFO2Q5TF58 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
IFFO2Q5TF58 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
IFFO2Q5TF58 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
IFFO2Q5TF58 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
IFFO2Q5TF58 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
IFFO2Q5TF58 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
IFFO2Q5TF58 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
IFFO2Q5TF58 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
IFFO2Q5TF58 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
IFFO2Q5TF58 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
IFFO2Q5TF58 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
IFFO2Q5TF58 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
IFFO2Q5TF58 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
IFFO2Q5TF58 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
IFFO2Q5TF58 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
IFFO2Q5TF58 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
IFFO2Q5TF58 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
IFFO2Q5TF58 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
IFFO2Q5TF58 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
IFFO2Q5TF58 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
IFFO2Q5TF58 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
IFFO2Q5TF58 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
IFFO2Q5TF58 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
IFFO2Q5TF58 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
IFFO2Q5TF58 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
IFFO2Q5TF58 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IFFO2Q5TF58 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
IFFO2Q5TF58 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
IFFO2Q5TF58 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IFFO2Q5TF58 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IFFO2Q5TF58 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
IFFO2Q5TF58 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
IFFO2Q5TF58 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
IFFO2Q5TF58 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IFFO2Q5TF58 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IFFO2Q5TF58 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IFFO2Q5TF58 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
IFFO2Q5TF58 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
IFFO2Q5TF58 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
IFFO2Q5TF58 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
IFFO2Q5TF58 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
IFFO2Q5TF58 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
IFFO2Q5TF58 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
IFFO2Q5TF58 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
IFFO2Q5TF58 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
IFFO2Q5TF58 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
IFFO2Q5TF58 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
IFFO2Q5TF58 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
IFFO2Q5TF58 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
IFFO2Q5TF58 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
IFFO2Q5TF58 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
IFFO2Q5TF58 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms