Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGSNQ5TDP6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGSNQ5TDP6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGSNQ5TDP6 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGSNQ5TDP6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGSNQ5TDP6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGSNQ5TDP6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGSNQ5TDP6 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGSNQ5TDP6 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGSNQ5TDP6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGSNQ5TDP6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGSNQ5TDP6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGSNQ5TDP6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGSNQ5TDP6 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGSNQ5TDP6 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGSNQ5TDP6 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGSNQ5TDP6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGSNQ5TDP6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LGSNQ5TDP6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LGSNQ5TDP6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LGSNQ5TDP6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LGSNQ5TDP6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LGSNQ5TDP6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LGSNQ5TDP6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LGSNQ5TDP6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LGSNQ5TDP6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LGSNQ5TDP6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LGSNQ5TDP6 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LGSNQ5TDP6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LGSNQ5TDP6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LGSNQ5TDP6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LGSNQ5TDP6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LGSNQ5TDP6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LGSNQ5TDP6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LGSNQ5TDP6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LGSNQ5TDP6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LGSNQ5TDP6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LGSNQ5TDP6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LGSNQ5TDP6 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LGSNQ5TDP6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LGSNQ5TDP6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LGSNQ5TDP6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LGSNQ5TDP6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LGSNQ5TDP6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
LGSNQ5TDP6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LGSNQ5TDP6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LGSNQ5TDP6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LGSNQ5TDP6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LGSNQ5TDP6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LGSNQ5TDP6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LGSNQ5TDP6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LGSNQ5TDP6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LGSNQ5TDP6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LGSNQ5TDP6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LGSNQ5TDP6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LGSNQ5TDP6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LGSNQ5TDP6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LGSNQ5TDP6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LGSNQ5TDP6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LGSNQ5TDP6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LGSNQ5TDP6 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LGSNQ5TDP6 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LGSNQ5TDP6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LGSNQ5TDP6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LGSNQ5TDP6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LGSNQ5TDP6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LGSNQ5TDP6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LGSNQ5TDP6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LGSNQ5TDP6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LGSNQ5TDP6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LGSNQ5TDP6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LGSNQ5TDP6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LGSNQ5TDP6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LGSNQ5TDP6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LGSNQ5TDP6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LGSNQ5TDP6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LGSNQ5TDP6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LGSNQ5TDP6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LGSNQ5TDP6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LGSNQ5TDP6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LGSNQ5TDP6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LGSNQ5TDP6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LGSNQ5TDP6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LGSNQ5TDP6 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LGSNQ5TDP6 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LGSNQ5TDP6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LGSNQ5TDP6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LGSNQ5TDP6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LGSNQ5TDP6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LGSNQ5TDP6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LGSNQ5TDP6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LGSNQ5TDP6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LGSNQ5TDP6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LGSNQ5TDP6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LGSNQ5TDP6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LGSNQ5TDP6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LGSNQ5TDP6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LGSNQ5TDP6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LGSNQ5TDP6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
LGSNQ5TDP6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms