Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC27A3Q5K4L6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC27A3Q5K4L6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC27A3Q5K4L6 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC27A3Q5K4L6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC27A3Q5K4L6 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC27A3Q5K4L6 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC27A3Q5K4L6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC27A3Q5K4L6 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC27A3Q5K4L6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC27A3Q5K4L6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC27A3Q5K4L6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC27A3Q5K4L6 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC27A3Q5K4L6 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC27A3Q5K4L6 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC27A3Q5K4L6 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC27A3Q5K4L6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC27A3Q5K4L6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC27A3Q5K4L6 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC27A3Q5K4L6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC27A3Q5K4L6 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC27A3Q5K4L6 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC27A3Q5K4L6 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC27A3Q5K4L6 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC27A3Q5K4L6 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC27A3Q5K4L6 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC27A3Q5K4L6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC27A3Q5K4L6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC27A3Q5K4L6 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC27A3Q5K4L6 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC27A3Q5K4L6 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC27A3Q5K4L6 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC27A3Q5K4L6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC27A3Q5K4L6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC27A3Q5K4L6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SLC27A3Q5K4L6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
SLC27A3Q5K4L6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SLC27A3Q5K4L6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLC27A3Q5K4L6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
SLC27A3Q5K4L6 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLC27A3Q5K4L6 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLC27A3Q5K4L6 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLC27A3Q5K4L6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLC27A3Q5K4L6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLC27A3Q5K4L6 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLC27A3Q5K4L6 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLC27A3Q5K4L6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC27A3Q5K4L6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC27A3Q5K4L6 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC27A3Q5K4L6 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC27A3Q5K4L6 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC27A3Q5K4L6 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC27A3Q5K4L6 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC27A3Q5K4L6 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC27A3Q5K4L6 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC27A3Q5K4L6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC27A3Q5K4L6 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC27A3Q5K4L6 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC27A3Q5K4L6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC27A3Q5K4L6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC27A3Q5K4L6 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC27A3Q5K4L6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC27A3Q5K4L6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC27A3Q5K4L6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC27A3Q5K4L6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC27A3Q5K4L6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC27A3Q5K4L6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC27A3Q5K4L6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC27A3Q5K4L6 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC27A3Q5K4L6 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC27A3Q5K4L6 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC27A3Q5K4L6 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC27A3Q5K4L6 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC27A3Q5K4L6 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC27A3Q5K4L6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC27A3Q5K4L6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC27A3Q5K4L6 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC27A3Q5K4L6 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC27A3Q5K4L6 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC27A3Q5K4L6 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC27A3Q5K4L6 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC27A3Q5K4L6 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC27A3Q5K4L6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC27A3Q5K4L6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC27A3Q5K4L6 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC27A3Q5K4L6 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC27A3Q5K4L6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC27A3Q5K4L6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC27A3Q5K4L6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC27A3Q5K4L6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC27A3Q5K4L6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC27A3Q5K4L6 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC27A3Q5K4L6 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC27A3Q5K4L6 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC27A3Q5K4L6 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC27A3Q5K4L6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC27A3Q5K4L6 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SLC27A3Q5K4L6 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SLC27A3Q5K4L6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SLC27A3Q5K4L6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms