Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GREB1Q4ZG55 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GREB1Q4ZG55 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GREB1Q4ZG55 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GREB1Q4ZG55 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GREB1Q4ZG55 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GREB1Q4ZG55 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GREB1Q4ZG55 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GREB1Q4ZG55 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GREB1Q4ZG55 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GREB1Q4ZG55 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GREB1Q4ZG55 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GREB1Q4ZG55 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GREB1Q4ZG55 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GREB1Q4ZG55 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GREB1Q4ZG55 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GREB1Q4ZG55 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GREB1Q4ZG55 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GREB1Q4ZG55 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GREB1Q4ZG55 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GREB1Q4ZG55 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GREB1Q4ZG55 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GREB1Q4ZG55 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GREB1Q4ZG55 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GREB1Q4ZG55 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GREB1Q4ZG55 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GREB1Q4ZG55 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GREB1Q4ZG55 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GREB1Q4ZG55 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GREB1Q4ZG55 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GREB1Q4ZG55 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GREB1Q4ZG55 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GREB1Q4ZG55 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GREB1Q4ZG55 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GREB1Q4ZG55 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GREB1Q4ZG55 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GREB1Q4ZG55 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GREB1Q4ZG55 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GREB1Q4ZG55 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GREB1Q4ZG55 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GREB1Q4ZG55 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GREB1Q4ZG55 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GREB1Q4ZG55 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GREB1Q4ZG55 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GREB1Q4ZG55 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GREB1Q4ZG55 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GREB1Q4ZG55 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GREB1Q4ZG55 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GREB1Q4ZG55 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GREB1Q4ZG55 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GREB1Q4ZG55 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GREB1Q4ZG55 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GREB1Q4ZG55 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GREB1Q4ZG55 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GREB1Q4ZG55 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GREB1Q4ZG55 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GREB1Q4ZG55 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GREB1Q4ZG55 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GREB1Q4ZG55 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GREB1Q4ZG55 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GREB1Q4ZG55 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GREB1Q4ZG55 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GREB1Q4ZG55 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GREB1Q4ZG55 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GREB1Q4ZG55 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GREB1Q4ZG55 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GREB1Q4ZG55 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GREB1Q4ZG55 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GREB1Q4ZG55 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GREB1Q4ZG55 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GREB1Q4ZG55 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GREB1Q4ZG55 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GREB1Q4ZG55 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GREB1Q4ZG55 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GREB1Q4ZG55 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GREB1Q4ZG55 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GREB1Q4ZG55 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GREB1Q4ZG55 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GREB1Q4ZG55 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GREB1Q4ZG55 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GREB1Q4ZG55 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GREB1Q4ZG55 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GREB1Q4ZG55 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GREB1Q4ZG55 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GREB1Q4ZG55 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GREB1Q4ZG55 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GREB1Q4ZG55 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GREB1Q4ZG55 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GREB1Q4ZG55 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GREB1Q4ZG55 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GREB1Q4ZG55 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GREB1Q4ZG55 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GREB1Q4ZG55 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GREB1Q4ZG55 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GREB1Q4ZG55 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GREB1Q4ZG55 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GREB1Q4ZG55 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GREB1Q4ZG55 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GREB1Q4ZG55 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GREB1Q4ZG55 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms