Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TPRNQ4KMQ1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TPRNQ4KMQ1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TPRNQ4KMQ1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TPRNQ4KMQ1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TPRNQ4KMQ1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TPRNQ4KMQ1 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TPRNQ4KMQ1 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TPRNQ4KMQ1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TPRNQ4KMQ1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TPRNQ4KMQ1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
TPRNQ4KMQ1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TPRNQ4KMQ1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TPRNQ4KMQ1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TPRNQ4KMQ1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TPRNQ4KMQ1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TPRNQ4KMQ1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TPRNQ4KMQ1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TPRNQ4KMQ1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TPRNQ4KMQ1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TPRNQ4KMQ1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TPRNQ4KMQ1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TPRNQ4KMQ1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TPRNQ4KMQ1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TPRNQ4KMQ1 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TPRNQ4KMQ1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TPRNQ4KMQ1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TPRNQ4KMQ1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TPRNQ4KMQ1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TPRNQ4KMQ1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TPRNQ4KMQ1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TPRNQ4KMQ1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TPRNQ4KMQ1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TPRNQ4KMQ1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TPRNQ4KMQ1 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TPRNQ4KMQ1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TPRNQ4KMQ1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TPRNQ4KMQ1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TPRNQ4KMQ1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TPRNQ4KMQ1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TPRNQ4KMQ1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TPRNQ4KMQ1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TPRNQ4KMQ1 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TPRNQ4KMQ1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TPRNQ4KMQ1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TPRNQ4KMQ1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TPRNQ4KMQ1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TPRNQ4KMQ1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TPRNQ4KMQ1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TPRNQ4KMQ1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TPRNQ4KMQ1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TPRNQ4KMQ1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TPRNQ4KMQ1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TPRNQ4KMQ1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TPRNQ4KMQ1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TPRNQ4KMQ1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TPRNQ4KMQ1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TPRNQ4KMQ1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TPRNQ4KMQ1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TPRNQ4KMQ1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TPRNQ4KMQ1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TPRNQ4KMQ1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TPRNQ4KMQ1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TPRNQ4KMQ1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TPRNQ4KMQ1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TPRNQ4KMQ1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TPRNQ4KMQ1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TPRNQ4KMQ1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TPRNQ4KMQ1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TPRNQ4KMQ1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TPRNQ4KMQ1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TPRNQ4KMQ1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TPRNQ4KMQ1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TPRNQ4KMQ1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TPRNQ4KMQ1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TPRNQ4KMQ1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TPRNQ4KMQ1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
TPRNQ4KMQ1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
TPRNQ4KMQ1 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
TPRNQ4KMQ1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TPRNQ4KMQ1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TPRNQ4KMQ1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TPRNQ4KMQ1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TPRNQ4KMQ1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TPRNQ4KMQ1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TPRNQ4KMQ1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TPRNQ4KMQ1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TPRNQ4KMQ1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TPRNQ4KMQ1 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TPRNQ4KMQ1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TPRNQ4KMQ1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TPRNQ4KMQ1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TPRNQ4KMQ1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TPRNQ4KMQ1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TPRNQ4KMQ1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TPRNQ4KMQ1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TPRNQ4KMQ1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TPRNQ4KMQ1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TPRNQ4KMQ1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TPRNQ4KMQ1 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
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