Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC27Q2M243 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC27Q2M243 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC27Q2M243 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC27Q2M243 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC27Q2M243 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC27Q2M243 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC27Q2M243 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC27Q2M243 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC27Q2M243 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC27Q2M243 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC27Q2M243 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC27Q2M243 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC27Q2M243 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC27Q2M243 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC27Q2M243 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC27Q2M243 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC27Q2M243 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC27Q2M243 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC27Q2M243 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC27Q2M243 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC27Q2M243 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC27Q2M243 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC27Q2M243 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC27Q2M243 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC27Q2M243 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC27Q2M243 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC27Q2M243 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC27Q2M243 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC27Q2M243 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC27Q2M243 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC27Q2M243 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC27Q2M243 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC27Q2M243 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC27Q2M243 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC27Q2M243 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC27Q2M243 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC27Q2M243 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC27Q2M243 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC27Q2M243 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC27Q2M243 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC27Q2M243 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC27Q2M243 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC27Q2M243 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC27Q2M243 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC27Q2M243 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC27Q2M243 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC27Q2M243 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CCDC27Q2M243 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CCDC27Q2M243 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC27Q2M243 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC27Q2M243 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC27Q2M243 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC27Q2M243 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC27Q2M243 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC27Q2M243 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC27Q2M243 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC27Q2M243 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC27Q2M243 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC27Q2M243 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC27Q2M243 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC27Q2M243 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC27Q2M243 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC27Q2M243 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC27Q2M243 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC27Q2M243 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC27Q2M243 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC27Q2M243 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC27Q2M243 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC27Q2M243 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC27Q2M243 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC27Q2M243 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC27Q2M243 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC27Q2M243 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC27Q2M243 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC27Q2M243 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC27Q2M243 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC27Q2M243 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC27Q2M243 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC27Q2M243 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC27Q2M243 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC27Q2M243 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC27Q2M243 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC27Q2M243 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC27Q2M243 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC27Q2M243 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC27Q2M243 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC27Q2M243 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC27Q2M243 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC27Q2M243 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC27Q2M243 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC27Q2M243 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC27Q2M243 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC27Q2M243 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC27Q2M243 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC27Q2M243 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC27Q2M243 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC27Q2M243 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC27Q2M243 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC27Q2M243 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms