Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM187BQ17R55 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM187BQ17R55 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM187BQ17R55 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM187BQ17R55 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM187BQ17R55 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM187BQ17R55 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM187BQ17R55 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM187BQ17R55 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM187BQ17R55 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM187BQ17R55 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM187BQ17R55 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM187BQ17R55 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM187BQ17R55 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM187BQ17R55 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM187BQ17R55 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM187BQ17R55 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM187BQ17R55 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM187BQ17R55 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM187BQ17R55 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM187BQ17R55 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM187BQ17R55 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM187BQ17R55 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM187BQ17R55 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM187BQ17R55 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM187BQ17R55 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM187BQ17R55 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
FAM187BQ17R55 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
FAM187BQ17R55 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FAM187BQ17R55 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FAM187BQ17R55 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FAM187BQ17R55 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM187BQ17R55 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM187BQ17R55 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM187BQ17R55 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM187BQ17R55 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM187BQ17R55 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM187BQ17R55 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM187BQ17R55 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM187BQ17R55 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM187BQ17R55 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM187BQ17R55 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM187BQ17R55 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM187BQ17R55 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM187BQ17R55 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM187BQ17R55 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM187BQ17R55 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM187BQ17R55 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM187BQ17R55 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM187BQ17R55 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM187BQ17R55 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM187BQ17R55 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM187BQ17R55 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM187BQ17R55 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM187BQ17R55 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM187BQ17R55 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM187BQ17R55 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM187BQ17R55 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM187BQ17R55 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM187BQ17R55 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM187BQ17R55 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM187BQ17R55 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM187BQ17R55 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM187BQ17R55 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM187BQ17R55 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM187BQ17R55 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM187BQ17R55 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM187BQ17R55 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM187BQ17R55 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM187BQ17R55 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM187BQ17R55 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM187BQ17R55 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM187BQ17R55 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM187BQ17R55 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM187BQ17R55 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM187BQ17R55 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM187BQ17R55 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM187BQ17R55 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM187BQ17R55 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM187BQ17R55 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM187BQ17R55 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM187BQ17R55 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM187BQ17R55 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM187BQ17R55 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM187BQ17R55 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM187BQ17R55 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM187BQ17R55 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM187BQ17R55 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM187BQ17R55 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM187BQ17R55 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM187BQ17R55 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM187BQ17R55 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM187BQ17R55 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM187BQ17R55 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM187BQ17R55 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM187BQ17R55 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM187BQ17R55 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM187BQ17R55 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM187BQ17R55 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM187BQ17R55 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
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