Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC6Q16204 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC6Q16204 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC6Q16204 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC6Q16204 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC6Q16204 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC6Q16204 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC6Q16204 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC6Q16204 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC6Q16204 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC6Q16204 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC6Q16204 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC6Q16204 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC6Q16204 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC6Q16204 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC6Q16204 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC6Q16204 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC6Q16204 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC6Q16204 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC6Q16204 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC6Q16204 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC6Q16204 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC6Q16204 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC6Q16204 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC6Q16204 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC6Q16204 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC6Q16204 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC6Q16204 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC6Q16204 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC6Q16204 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC6Q16204 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC6Q16204 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC6Q16204 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC6Q16204 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC6Q16204 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC6Q16204 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC6Q16204 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC6Q16204 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC6Q16204 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC6Q16204 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC6Q16204 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC6Q16204 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC6Q16204 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC6Q16204 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC6Q16204 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC6Q16204 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC6Q16204 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC6Q16204 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC6Q16204 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC6Q16204 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC6Q16204 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC6Q16204 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC6Q16204 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC6Q16204 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC6Q16204 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC6Q16204 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC6Q16204 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC6Q16204 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC6Q16204 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC6Q16204 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC6Q16204 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC6Q16204 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC6Q16204 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC6Q16204 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC6Q16204 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC6Q16204 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC6Q16204 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC6Q16204 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC6Q16204 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC6Q16204 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC6Q16204 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC6Q16204 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC6Q16204 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC6Q16204 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC6Q16204 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC6Q16204 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC6Q16204 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC6Q16204 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC6Q16204 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC6Q16204 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC6Q16204 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC6Q16204 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC6Q16204 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC6Q16204 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC6Q16204 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC6Q16204 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC6Q16204 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC6Q16204 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC6Q16204 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC6Q16204 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC6Q16204 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC6Q16204 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC6Q16204 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC6Q16204 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC6Q16204 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC6Q16204 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC6Q16204 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC6Q16204 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC6Q16204 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC6Q16204 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
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