Protein–RNA interactions for Protein: Q15345

LRRC41, Leucine-rich repeat-containing protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC41Q15345 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC41Q15345 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC41Q15345 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC41Q15345 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC41Q15345 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC41Q15345 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC41Q15345 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC41Q15345 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC41Q15345 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC41Q15345 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC41Q15345 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC41Q15345 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC41Q15345 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC41Q15345 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC41Q15345 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
LRRC41Q15345 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LRRC41Q15345 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LRRC41Q15345 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC41Q15345 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC41Q15345 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC41Q15345 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC41Q15345 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC41Q15345 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC41Q15345 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC41Q15345 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC41Q15345 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC41Q15345 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC41Q15345 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC41Q15345 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC41Q15345 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC41Q15345 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC41Q15345 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC41Q15345 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC41Q15345 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC41Q15345 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC41Q15345 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC41Q15345 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC41Q15345 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC41Q15345 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC41Q15345 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC41Q15345 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC41Q15345 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC41Q15345 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC41Q15345 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC41Q15345 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC41Q15345 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC41Q15345 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC41Q15345 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC41Q15345 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC41Q15345 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC41Q15345 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC41Q15345 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC41Q15345 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC41Q15345 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC41Q15345 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC41Q15345 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC41Q15345 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC41Q15345 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC41Q15345 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC41Q15345 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC41Q15345 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC41Q15345 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC41Q15345 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC41Q15345 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC41Q15345 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC41Q15345 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC41Q15345 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC41Q15345 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC41Q15345 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC41Q15345 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC41Q15345 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC41Q15345 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC41Q15345 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC41Q15345 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC41Q15345 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC41Q15345 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC41Q15345 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC41Q15345 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC41Q15345 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC41Q15345 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC41Q15345 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC41Q15345 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC41Q15345 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC41Q15345 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC41Q15345 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC41Q15345 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC41Q15345 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC41Q15345 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC41Q15345 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC41Q15345 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC41Q15345 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC41Q15345 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC41Q15345 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC41Q15345 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC41Q15345 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC41Q15345 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC41Q15345 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC41Q15345 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC41Q15345 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC41Q15345 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
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