Protein–RNA interactions for Protein: Q15046

KARS, Lysine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARSQ15046 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KARSQ15046 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KARSQ15046 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KARSQ15046 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KARSQ15046 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KARSQ15046 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KARSQ15046 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KARSQ15046 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KARSQ15046 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KARSQ15046 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KARSQ15046 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KARSQ15046 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KARSQ15046 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KARSQ15046 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KARSQ15046 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KARSQ15046 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KARSQ15046 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KARSQ15046 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KARSQ15046 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KARSQ15046 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KARSQ15046 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KARSQ15046 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KARSQ15046 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KARSQ15046 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KARSQ15046 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KARSQ15046 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KARSQ15046 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KARSQ15046 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KARSQ15046 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
KARSQ15046 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KARSQ15046 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KARSQ15046 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KARSQ15046 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KARSQ15046 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KARSQ15046 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KARSQ15046 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KARSQ15046 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KARSQ15046 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KARSQ15046 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KARSQ15046 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KARSQ15046 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KARSQ15046 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KARSQ15046 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KARSQ15046 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KARSQ15046 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KARSQ15046 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KARSQ15046 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KARSQ15046 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
KARSQ15046 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KARSQ15046 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KARSQ15046 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KARSQ15046 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KARSQ15046 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KARSQ15046 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KARSQ15046 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KARSQ15046 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KARSQ15046 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KARSQ15046 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KARSQ15046 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KARSQ15046 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KARSQ15046 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KARSQ15046 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
KARSQ15046 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KARSQ15046 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KARSQ15046 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KARSQ15046 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KARSQ15046 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KARSQ15046 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KARSQ15046 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KARSQ15046 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KARSQ15046 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
KARSQ15046 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KARSQ15046 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
KARSQ15046 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KARSQ15046 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
KARSQ15046 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KARSQ15046 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KARSQ15046 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KARSQ15046 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KARSQ15046 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KARSQ15046 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KARSQ15046 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KARSQ15046 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KARSQ15046 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KARSQ15046 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KARSQ15046 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KARSQ15046 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KARSQ15046 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KARSQ15046 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KARSQ15046 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KARSQ15046 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KARSQ15046 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KARSQ15046 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KARSQ15046 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KARSQ15046 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KARSQ15046 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KARSQ15046 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KARSQ15046 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KARSQ15046 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KARSQ15046 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
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