Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
R3HDM1Q15032 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
R3HDM1Q15032 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
R3HDM1Q15032 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
R3HDM1Q15032 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
R3HDM1Q15032 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
R3HDM1Q15032 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
R3HDM1Q15032 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
R3HDM1Q15032 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
R3HDM1Q15032 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
R3HDM1Q15032 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
R3HDM1Q15032 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
R3HDM1Q15032 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
R3HDM1Q15032 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
R3HDM1Q15032 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
R3HDM1Q15032 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
R3HDM1Q15032 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
R3HDM1Q15032 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
R3HDM1Q15032 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
R3HDM1Q15032 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
R3HDM1Q15032 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
R3HDM1Q15032 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
R3HDM1Q15032 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
R3HDM1Q15032 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
R3HDM1Q15032 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
R3HDM1Q15032 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
R3HDM1Q15032 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
R3HDM1Q15032 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
R3HDM1Q15032 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
R3HDM1Q15032 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
R3HDM1Q15032 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
R3HDM1Q15032 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
R3HDM1Q15032 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
R3HDM1Q15032 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
R3HDM1Q15032 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
R3HDM1Q15032 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
R3HDM1Q15032 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
R3HDM1Q15032 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
R3HDM1Q15032 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
R3HDM1Q15032 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
R3HDM1Q15032 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
R3HDM1Q15032 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
R3HDM1Q15032 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
R3HDM1Q15032 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
R3HDM1Q15032 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
R3HDM1Q15032 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
R3HDM1Q15032 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
R3HDM1Q15032 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
R3HDM1Q15032 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
R3HDM1Q15032 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
R3HDM1Q15032 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
R3HDM1Q15032 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
R3HDM1Q15032 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
R3HDM1Q15032 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
R3HDM1Q15032 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
R3HDM1Q15032 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
R3HDM1Q15032 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
R3HDM1Q15032 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
R3HDM1Q15032 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
R3HDM1Q15032 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
R3HDM1Q15032 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
R3HDM1Q15032 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
R3HDM1Q15032 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
R3HDM1Q15032 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
R3HDM1Q15032 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
R3HDM1Q15032 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
R3HDM1Q15032 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
R3HDM1Q15032 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
R3HDM1Q15032 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
R3HDM1Q15032 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
R3HDM1Q15032 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
R3HDM1Q15032 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
R3HDM1Q15032 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
R3HDM1Q15032 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
R3HDM1Q15032 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
R3HDM1Q15032 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
R3HDM1Q15032 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
R3HDM1Q15032 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
R3HDM1Q15032 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
R3HDM1Q15032 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
R3HDM1Q15032 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
R3HDM1Q15032 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
R3HDM1Q15032 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
R3HDM1Q15032 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
R3HDM1Q15032 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
R3HDM1Q15032 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
R3HDM1Q15032 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
R3HDM1Q15032 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
R3HDM1Q15032 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
R3HDM1Q15032 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
R3HDM1Q15032 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
R3HDM1Q15032 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
R3HDM1Q15032 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
R3HDM1Q15032 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
R3HDM1Q15032 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
R3HDM1Q15032 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
R3HDM1Q15032 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
R3HDM1Q15032 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
R3HDM1Q15032 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
R3HDM1Q15032 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
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