Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC36.57■■■■□ 3.45
GAPVD1Q14C86 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC36.57■■■■□ 3.45
GAPVD1Q14C86 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC36.57■■■■□ 3.45
GAPVD1Q14C86 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
GAPVD1Q14C86 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
GAPVD1Q14C86 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC36.56■■■■□ 3.44
GAPVD1Q14C86 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
GAPVD1Q14C86 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
GAPVD1Q14C86 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
GAPVD1Q14C86 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
GAPVD1Q14C86 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
GAPVD1Q14C86 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
GAPVD1Q14C86 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
GAPVD1Q14C86 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
GAPVD1Q14C86 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
GAPVD1Q14C86 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
GAPVD1Q14C86 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC36.55■■■■□ 3.44
GAPVD1Q14C86 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
GAPVD1Q14C86 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
GAPVD1Q14C86 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
GAPVD1Q14C86 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
GAPVD1Q14C86 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
GAPVD1Q14C86 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
GAPVD1Q14C86 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
GAPVD1Q14C86 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
GAPVD1Q14C86 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
GAPVD1Q14C86 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
GAPVD1Q14C86 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
GAPVD1Q14C86 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
GAPVD1Q14C86 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
GAPVD1Q14C86 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
GAPVD1Q14C86 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
GAPVD1Q14C86 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
GAPVD1Q14C86 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
GAPVD1Q14C86 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
GAPVD1Q14C86 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
GAPVD1Q14C86 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
GAPVD1Q14C86 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
GAPVD1Q14C86 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
GAPVD1Q14C86 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
GAPVD1Q14C86 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
GAPVD1Q14C86 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
GAPVD1Q14C86 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
GAPVD1Q14C86 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
GAPVD1Q14C86 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
GAPVD1Q14C86 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC36.5■■■■□ 3.43
GAPVD1Q14C86 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
GAPVD1Q14C86 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
GAPVD1Q14C86 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC36.49■■■■□ 3.43
GAPVD1Q14C86 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
GAPVD1Q14C86 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
GAPVD1Q14C86 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
GAPVD1Q14C86 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
GAPVD1Q14C86 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
GAPVD1Q14C86 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
GAPVD1Q14C86 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
GAPVD1Q14C86 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
GAPVD1Q14C86 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
GAPVD1Q14C86 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
GAPVD1Q14C86 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
GAPVD1Q14C86 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
GAPVD1Q14C86 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
GAPVD1Q14C86 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
GAPVD1Q14C86 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
GAPVD1Q14C86 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
GAPVD1Q14C86 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
GAPVD1Q14C86 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
GAPVD1Q14C86 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC36.45■■■■□ 3.43
GAPVD1Q14C86 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
GAPVD1Q14C86 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
GAPVD1Q14C86 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.43
GAPVD1Q14C86 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
GAPVD1Q14C86 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
GAPVD1Q14C86 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
GAPVD1Q14C86 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
GAPVD1Q14C86 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC36.44■■■■□ 3.42
GAPVD1Q14C86 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.44■■■■□ 3.42
GAPVD1Q14C86 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
GAPVD1Q14C86 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
GAPVD1Q14C86 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
GAPVD1Q14C86 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
GAPVD1Q14C86 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
GAPVD1Q14C86 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
GAPVD1Q14C86 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
GAPVD1Q14C86 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
GAPVD1Q14C86 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
GAPVD1Q14C86 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
GAPVD1Q14C86 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
GAPVD1Q14C86 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
GAPVD1Q14C86 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
GAPVD1Q14C86 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
GAPVD1Q14C86 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
GAPVD1Q14C86 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
GAPVD1Q14C86 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
GAPVD1Q14C86 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
GAPVD1Q14C86 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
GAPVD1Q14C86 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
GAPVD1Q14C86 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
GAPVD1Q14C86 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
GAPVD1Q14C86 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
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