Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PDE6HQ13956 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PDE6HQ13956 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PDE6HQ13956 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PDE6HQ13956 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PDE6HQ13956 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PDE6HQ13956 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PDE6HQ13956 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PDE6HQ13956 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PDE6HQ13956 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PDE6HQ13956 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PDE6HQ13956 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PDE6HQ13956 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PDE6HQ13956 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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PDE6HQ13956 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PDE6HQ13956 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PDE6HQ13956 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PDE6HQ13956 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PDE6HQ13956 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
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PDE6HQ13956 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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PDE6HQ13956 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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PDE6HQ13956 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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PDE6HQ13956 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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PDE6HQ13956 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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PDE6HQ13956 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PDE6HQ13956 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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PDE6HQ13956 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PDE6HQ13956 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PDE6HQ13956 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PDE6HQ13956 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PDE6HQ13956 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PDE6HQ13956 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDE6HQ13956 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDE6HQ13956 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDE6HQ13956 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PDE6HQ13956 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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