Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HDAC1Q13547 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HDAC1Q13547 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
HDAC1Q13547 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
HDAC1Q13547 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
HDAC1Q13547 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
HDAC1Q13547 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
HDAC1Q13547 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
HDAC1Q13547 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
HDAC1Q13547 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
HDAC1Q13547 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
HDAC1Q13547 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HDAC1Q13547 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HDAC1Q13547 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HDAC1Q13547 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HDAC1Q13547 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
HDAC1Q13547 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HDAC1Q13547 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HDAC1Q13547 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HDAC1Q13547 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HDAC1Q13547 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HDAC1Q13547 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HDAC1Q13547 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HDAC1Q13547 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HDAC1Q13547 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HDAC1Q13547 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HDAC1Q13547 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
HDAC1Q13547 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HDAC1Q13547 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HDAC1Q13547 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HDAC1Q13547 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HDAC1Q13547 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HDAC1Q13547 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
HDAC1Q13547 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HDAC1Q13547 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HDAC1Q13547 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HDAC1Q13547 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HDAC1Q13547 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
HDAC1Q13547 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
HDAC1Q13547 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HDAC1Q13547 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HDAC1Q13547 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HDAC1Q13547 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HDAC1Q13547 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HDAC1Q13547 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HDAC1Q13547 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HDAC1Q13547 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HDAC1Q13547 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HDAC1Q13547 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HDAC1Q13547 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HDAC1Q13547 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
HDAC1Q13547 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
HDAC1Q13547 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
HDAC1Q13547 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
HDAC1Q13547 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HDAC1Q13547 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HDAC1Q13547 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HDAC1Q13547 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HDAC1Q13547 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HDAC1Q13547 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HDAC1Q13547 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HDAC1Q13547 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HDAC1Q13547 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HDAC1Q13547 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HDAC1Q13547 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HDAC1Q13547 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
HDAC1Q13547 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HDAC1Q13547 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HDAC1Q13547 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HDAC1Q13547 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HDAC1Q13547 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HDAC1Q13547 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HDAC1Q13547 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HDAC1Q13547 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HDAC1Q13547 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HDAC1Q13547 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HDAC1Q13547 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HDAC1Q13547 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HDAC1Q13547 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HDAC1Q13547 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HDAC1Q13547 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HDAC1Q13547 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HDAC1Q13547 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HDAC1Q13547 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HDAC1Q13547 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HDAC1Q13547 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HDAC1Q13547 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
HDAC1Q13547 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HDAC1Q13547 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
HDAC1Q13547 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HDAC1Q13547 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HDAC1Q13547 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HDAC1Q13547 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HDAC1Q13547 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HDAC1Q13547 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HDAC1Q13547 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HDAC1Q13547 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HDAC1Q13547 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HDAC1Q13547 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HDAC1Q13547 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms