Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBB3Q13509 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBB3Q13509 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBB3Q13509 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBB3Q13509 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBB3Q13509 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBB3Q13509 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBB3Q13509 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBB3Q13509 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBB3Q13509 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBB3Q13509 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBB3Q13509 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBB3Q13509 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBB3Q13509 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBB3Q13509 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBB3Q13509 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBB3Q13509 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBB3Q13509 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBB3Q13509 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBB3Q13509 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBB3Q13509 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBB3Q13509 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBB3Q13509 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBB3Q13509 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBB3Q13509 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBB3Q13509 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBB3Q13509 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBB3Q13509 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBB3Q13509 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBB3Q13509 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBB3Q13509 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBB3Q13509 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBB3Q13509 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBB3Q13509 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBB3Q13509 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBB3Q13509 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBB3Q13509 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBB3Q13509 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBB3Q13509 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBB3Q13509 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBB3Q13509 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBB3Q13509 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBB3Q13509 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBB3Q13509 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBB3Q13509 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBB3Q13509 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBB3Q13509 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBB3Q13509 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBB3Q13509 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBB3Q13509 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBB3Q13509 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBB3Q13509 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBB3Q13509 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBB3Q13509 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBB3Q13509 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBB3Q13509 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBB3Q13509 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBB3Q13509 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBB3Q13509 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBB3Q13509 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBB3Q13509 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBB3Q13509 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBB3Q13509 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBB3Q13509 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBB3Q13509 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBB3Q13509 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBB3Q13509 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBB3Q13509 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBB3Q13509 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBB3Q13509 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBB3Q13509 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBB3Q13509 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBB3Q13509 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBB3Q13509 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBB3Q13509 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBB3Q13509 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBB3Q13509 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBB3Q13509 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBB3Q13509 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBB3Q13509 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBB3Q13509 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBB3Q13509 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBB3Q13509 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBB3Q13509 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBB3Q13509 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBB3Q13509 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TUBB3Q13509 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBB3Q13509 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBB3Q13509 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBB3Q13509 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBB3Q13509 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBB3Q13509 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBB3Q13509 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBB3Q13509 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBB3Q13509 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBB3Q13509 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBB3Q13509 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBB3Q13509 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBB3Q13509 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBB3Q13509 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
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