Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
EFEMP1Q12805 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EFEMP1Q12805 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
EFEMP1Q12805 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EFEMP1Q12805 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFEMP1Q12805 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFEMP1Q12805 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
EFEMP1Q12805 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFEMP1Q12805 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFEMP1Q12805 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFEMP1Q12805 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFEMP1Q12805 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFEMP1Q12805 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFEMP1Q12805 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFEMP1Q12805 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFEMP1Q12805 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFEMP1Q12805 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EFEMP1Q12805 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EFEMP1Q12805 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EFEMP1Q12805 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EFEMP1Q12805 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
EFEMP1Q12805 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EFEMP1Q12805 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EFEMP1Q12805 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
EFEMP1Q12805 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EFEMP1Q12805 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EFEMP1Q12805 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EFEMP1Q12805 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EFEMP1Q12805 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EFEMP1Q12805 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFEMP1Q12805 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFEMP1Q12805 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFEMP1Q12805 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFEMP1Q12805 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFEMP1Q12805 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFEMP1Q12805 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFEMP1Q12805 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFEMP1Q12805 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
EFEMP1Q12805 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFEMP1Q12805 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
EFEMP1Q12805 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFEMP1Q12805 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFEMP1Q12805 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFEMP1Q12805 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFEMP1Q12805 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFEMP1Q12805 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFEMP1Q12805 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EFEMP1Q12805 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EFEMP1Q12805 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EFEMP1Q12805 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EFEMP1Q12805 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EFEMP1Q12805 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EFEMP1Q12805 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EFEMP1Q12805 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
EFEMP1Q12805 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EFEMP1Q12805 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
EFEMP1Q12805 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EFEMP1Q12805 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EFEMP1Q12805 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EFEMP1Q12805 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFEMP1Q12805 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFEMP1Q12805 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFEMP1Q12805 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFEMP1Q12805 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFEMP1Q12805 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFEMP1Q12805 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFEMP1Q12805 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFEMP1Q12805 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFEMP1Q12805 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFEMP1Q12805 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFEMP1Q12805 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFEMP1Q12805 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFEMP1Q12805 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFEMP1Q12805 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
EFEMP1Q12805 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFEMP1Q12805 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFEMP1Q12805 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFEMP1Q12805 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFEMP1Q12805 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
EFEMP1Q12805 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
EFEMP1Q12805 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFEMP1Q12805 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFEMP1Q12805 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFEMP1Q12805 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFEMP1Q12805 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFEMP1Q12805 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFEMP1Q12805 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFEMP1Q12805 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFEMP1Q12805 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
EFEMP1Q12805 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFEMP1Q12805 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFEMP1Q12805 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFEMP1Q12805 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFEMP1Q12805 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFEMP1Q12805 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFEMP1Q12805 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFEMP1Q12805 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFEMP1Q12805 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFEMP1Q12805 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFEMP1Q12805 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
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