Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GTF3C1Q12789 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GTF3C1Q12789 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GTF3C1Q12789 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GTF3C1Q12789 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GTF3C1Q12789 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GTF3C1Q12789 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GTF3C1Q12789 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GTF3C1Q12789 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GTF3C1Q12789 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GTF3C1Q12789 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GTF3C1Q12789 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GTF3C1Q12789 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GTF3C1Q12789 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GTF3C1Q12789 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GTF3C1Q12789 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GTF3C1Q12789 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GTF3C1Q12789 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GTF3C1Q12789 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
GTF3C1Q12789 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
GTF3C1Q12789 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GTF3C1Q12789 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
GTF3C1Q12789 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
GTF3C1Q12789 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.74
GTF3C1Q12789 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
GTF3C1Q12789 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
GTF3C1Q12789 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.74
GTF3C1Q12789 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
GTF3C1Q12789 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
GTF3C1Q12789 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
GTF3C1Q12789 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
GTF3C1Q12789 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GTF3C1Q12789 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GTF3C1Q12789 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GTF3C1Q12789 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GTF3C1Q12789 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GTF3C1Q12789 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GTF3C1Q12789 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GTF3C1Q12789 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GTF3C1Q12789 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GTF3C1Q12789 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GTF3C1Q12789 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GTF3C1Q12789 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GTF3C1Q12789 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GTF3C1Q12789 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GTF3C1Q12789 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
GTF3C1Q12789 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GTF3C1Q12789 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
GTF3C1Q12789 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GTF3C1Q12789 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GTF3C1Q12789 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GTF3C1Q12789 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GTF3C1Q12789 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GTF3C1Q12789 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GTF3C1Q12789 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GTF3C1Q12789 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
GTF3C1Q12789 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GTF3C1Q12789 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GTF3C1Q12789 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GTF3C1Q12789 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GTF3C1Q12789 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GTF3C1Q12789 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GTF3C1Q12789 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GTF3C1Q12789 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GTF3C1Q12789 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
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GTF3C1Q12789 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
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GTF3C1Q12789 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GTF3C1Q12789 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
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GTF3C1Q12789 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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GTF3C1Q12789 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
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GTF3C1Q12789 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF3C1Q12789 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF3C1Q12789 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF3C1Q12789 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF3C1Q12789 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF3C1Q12789 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF3C1Q12789 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF3C1Q12789 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF3C1Q12789 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF3C1Q12789 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF3C1Q12789 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF3C1Q12789 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF3C1Q12789 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF3C1Q12789 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF3C1Q12789 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF3C1Q12789 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF3C1Q12789 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF3C1Q12789 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF3C1Q12789 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF3C1Q12789 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF3C1Q12789 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF3C1Q12789 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF3C1Q12789 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF3C1Q12789 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
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