Protein–RNA interactions for Protein: Q12745

SEC39, Protein transport protein SEC39, yeastyeast

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC39Q12745 YGL258W-AYGL258W-A 234 nt4.3□□□□□ -1.72
SEC39Q12745 PSY3YLR376C 729 nt4.3□□□□□ -1.72
SEC39Q12745 SIW14YNL032W 846 nt4.3□□□□□ -1.72
SEC39Q12745 REX4YOL080C 870 nt4.3□□□□□ -1.72
SEC39Q12745 CIN5YOR028C 888 nt4.3□□□□□ -1.72
SEC39Q12745 GLO4YOR040W 858 nt4.3□□□□□ -1.72
SEC39Q12745 YAR1YPL239W 603 nt4.3□□□□□ -1.72
SEC39Q12745 SPN1YPR133C 1233 nt4.3□□□□□ -1.72
SEC39Q12745 MET12YPL023C 1974 nt4.29□□□□□ -1.72
SEC39Q12745 SRP72YPL210C 1923 nt4.29□□□□□ -1.72
SEC39Q12745 MAF1YDR005C 1188 nt4.29□□□□□ -1.72
SEC39Q12745 YDR336WYDR336W 945 nt4.29□□□□□ -1.72
SEC39Q12745 TYS1YGR185C 1185 nt4.29□□□□□ -1.72
SEC39Q12745 RTA1YGR213C 954 nt4.29□□□□□ -1.72
SEC39Q12745 SOP4YJL192C 705 nt4.29□□□□□ -1.72
SEC39Q12745 PIR3YKL163W 978 nt4.29□□□□□ -1.72
SEC39Q12745 MRPL20YKR085C 588 nt4.29□□□□□ -1.72
SEC39Q12745 YLR156WYLR156W 345 nt4.29□□□□□ -1.72
SEC39Q12745 YLR157W-DYLR157W-D 213 nt4.29□□□□□ -1.72
SEC39Q12745 YLR159WYLR159W 345 nt4.29□□□□□ -1.72
SEC39Q12745 YLR161WYLR161W 345 nt4.29□□□□□ -1.72
SEC39Q12745 YMR178WYMR178W 825 nt4.29□□□□□ -1.72
SEC39Q12745 NIS1YNL078W 1224 nt4.29□□□□□ -1.72
SEC39Q12745 TEX1YNL253W 1269 nt4.29□□□□□ -1.72
SEC39Q12745 STV1YMR054W 2673 nt4.29□□□□□ -1.72
SEC39Q12745 STB3YDR169C 1542 nt4.29□□□□□ -1.72
SEC39Q12745 RPB2YOR151C 3675 nt4.28□□□□□ -1.72
SEC39Q12745 SLX8YER116C 825 nt4.28□□□□□ -1.72
SEC39Q12745 MRPS35YGR165W 1038 nt4.28□□□□□ -1.72
SEC39Q12745 YKE4YIL023C 1041 nt4.28□□□□□ -1.72
SEC39Q12745 COA3YJL062W-A 258 nt4.28□□□□□ -1.72
SEC39Q12745 NMA1YLR328W 1206 nt4.28□□□□□ -1.72
SEC39Q12745 SWC7YLR385C 399 nt4.28□□□□□ -1.72
SEC39Q12745 PCL1YNL289W 840 nt4.28□□□□□ -1.72
SEC39Q12745 DSC2YOL073C 969 nt4.28□□□□□ -1.72
SEC39Q12745 YOL166CYOL166C 339 nt4.28□□□□□ -1.72
SEC39Q12745 BOI2YER114C 3123 nt4.28□□□□□ -1.72
SEC39Q12745 HCM1YCR065W 1695 nt4.28□□□□□ -1.72
SEC39Q12745 GPI10YGL142C 1851 nt4.28□□□□□ -1.72
SEC39Q12745 MCM7YBR202W 2538 nt4.28□□□□□ -1.72
SEC39Q12745 BCH2YKR027W 2298 nt4.28□□□□□ -1.72
SEC39Q12745 PPZ1YML016C 2079 nt4.27□□□□□ -1.73
SEC39Q12745 SPO1YNL012W 1896 nt4.27□□□□□ -1.73
SEC39Q12745 YDR161WYDR161W 1164 nt4.27□□□□□ -1.73
SEC39Q12745 YDR290WYDR290W 330 nt4.27□□□□□ -1.73
SEC39Q12745 SPI1YER150W 447 nt4.27□□□□□ -1.73
SEC39Q12745 YGL132WYGL132W 336 nt4.27□□□□□ -1.73
SEC39Q12745 PEX21YGR239C 867 nt4.27□□□□□ -1.73
SEC39Q12745 IMP3YHR148W 552 nt4.27□□□□□ -1.73
SEC39Q12745 EBP2YKL172W 1284 nt4.27□□□□□ -1.73
SEC39Q12745 IAH1YOR126C 717 nt4.27□□□□□ -1.73
SEC39Q12745 YOR314WYOR314W 330 nt4.27□□□□□ -1.73
SEC39Q12745 BMT2YBR141C 1014 nt4.27□□□□□ -1.73
SEC39Q12745 GZF3YJL110C 1656 nt4.26□□□□□ -1.73
SEC39Q12745 RAD54YGL163C 2697 nt4.26□□□□□ -1.73
SEC39Q12745 RIM4YHL024W 2142 nt4.26□□□□□ -1.73
SEC39Q12745 DCS1YLR270W 1053 nt4.26□□□□□ -1.73
SEC39Q12745 SHE1YBL031W 1017 nt4.26□□□□□ -1.73
SEC39Q12745 YMR130WYMR130W 909 nt4.26□□□□□ -1.73
SEC39Q12745 PRX1YBL064C 786 nt4.26□□□□□ -1.73
SEC39Q12745 YPT53YNL093W 663 nt4.26□□□□□ -1.73
SEC39Q12745 AAH1YNL141W 1044 nt4.26□□□□□ -1.73
SEC39Q12745 FAS2YPL231W 5664 nt4.26□□□□□ -1.73
SEC39Q12745 HCA4YJL033W 2313 nt4.26□□□□□ -1.73
SEC39Q12745 SWI1YPL016W 3945 nt4.25□□□□□ -1.73
SEC39Q12745 CPR4YCR069W 957 nt4.25□□□□□ -1.73
SEC39Q12745 DDI2YFL061W 678 nt4.25□□□□□ -1.73
SEC39Q12745 PTR3YFR029W 2037 nt4.25□□□□□ -1.73
SEC39Q12745 LOH1YJL038C 660 nt4.25□□□□□ -1.73
SEC39Q12745 RPL14AYKL006W 417 nt4.25□□□□□ -1.73
SEC39Q12745 LAC1YKL008C 1257 nt4.25□□□□□ -1.73
SEC39Q12745 YLR363W-AYLR363W-A 258 nt4.25□□□□□ -1.73
SEC39Q12745 CTL1YMR180C 963 nt4.25□□□□□ -1.73
SEC39Q12745 DDI3YNL335W 678 nt4.25□□□□□ -1.73
SEC39Q12745 SPO19YPL130W 672 nt4.25□□□□□ -1.73
SEC39Q12745 ADP1YCR011C 3150 nt4.25□□□□□ -1.73
SEC39Q12745 KAR5YMR065W 1515 nt4.25□□□□□ -1.73
SEC39Q12745 GLO3YER122C 1482 nt4.24□□□□□ -1.73
SEC39Q12745 POL31YJR006W 1464 nt4.24□□□□□ -1.73
SEC39Q12745 CBF5YLR175W 1452 nt4.24□□□□□ -1.73
SEC39Q12745 AZR1YGR224W 1842 nt4.24□□□□□ -1.73
SEC39Q12745 YDR526CYDR526C 471 nt4.24□□□□□ -1.73
SEC39Q12745 NKP2YLR315W 462 nt4.24□□□□□ -1.73
SEC39Q12745 PNT1YOR266W 1272 nt4.24□□□□□ -1.73
SEC39Q12745 PNG1YPL096W 1092 nt4.24□□□□□ -1.73
SEC39Q12745 YPL278CYPL278C 303 nt4.24□□□□□ -1.73
SEC39Q12745 PHO87YCR037C 2772 nt4.24□□□□□ -1.73
SEC39Q12745 PTA1YAL043C 2358 nt4.24□□□□□ -1.73
SEC39Q12745 AVT7YIL088C 1473 nt4.24□□□□□ -1.73
SEC39Q12745 RAD26YJR035W 3258 nt4.23□□□□□ -1.73
SEC39Q12745 YPR003CYPR003C 2265 nt4.23□□□□□ -1.73
SEC39Q12745 PCL2YDL127W 927 nt4.23□□□□□ -1.73
SEC39Q12745 tQ(UUG)CtQ(UUG)C 72 nt4.23□□□□□ -1.73
SEC39Q12745 tQ(UUG)D1tQ(UUG)D1 72 nt4.23□□□□□ -1.73
SEC39Q12745 tQ(UUG)D2tQ(UUG)D2 72 nt4.23□□□□□ -1.73
SEC39Q12745 tQ(UUG)D3tQ(UUG)D3 72 nt4.23□□□□□ -1.73
SEC39Q12745 tQ(UUG)E1tQ(UUG)E1 72 nt4.23□□□□□ -1.73
SEC39Q12745 tQ(UUG)HtQ(UUG)H 72 nt4.23□□□□□ -1.73
SEC39Q12745 tQ(UUG)LtQ(UUG)L 72 nt4.23□□□□□ -1.73
SEC39Q12745 SEC72YLR292C 582 nt4.23□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.8 ms