Protein–RNA interactions for Protein: Q12048

ATG41, Autophagy-related protein 41, yeastyeast

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG41Q12048 snR37snR37 386 nt3□□□□□ -1.93
ATG41Q12048 CDC9YDL164C 2268 nt3□□□□□ -1.93
ATG41Q12048 MYO3YKL129C 3819 nt3□□□□□ -1.93
ATG41Q12048 PTM1YKL039W 1572 nt3□□□□□ -1.93
ATG41Q12048 TCB3YML072C 4638 nt2.99□□□□□ -1.93
ATG41Q12048 TGL3YMR313C 1929 nt2.99□□□□□ -1.93
ATG41Q12048 RAD2YGR258C 3096 nt2.99□□□□□ -1.93
ATG41Q12048 RRP5YMR229C 5190 nt2.99□□□□□ -1.93
ATG41Q12048 SUP45YBR143C 1314 nt2.99□□□□□ -1.93
ATG41Q12048 PET54YGR222W 882 nt2.99□□□□□ -1.93
ATG41Q12048 SWC7YLR385C 399 nt2.99□□□□□ -1.93
ATG41Q12048 MCK1YNL307C 1128 nt2.99□□□□□ -1.93
ATG41Q12048 CSR2YPR030W 3366 nt2.99□□□□□ -1.93
ATG41Q12048 MDL1YLR188W 2088 nt2.99□□□□□ -1.93
ATG41Q12048 NUP85YJR042W 2235 nt2.99□□□□□ -1.93
ATG41Q12048 KRE5YOR336W 4098 nt2.98□□□□□ -1.93
ATG41Q12048 GGA1YDR358W 1674 nt2.98□□□□□ -1.93
ATG41Q12048 RGP1YDR137W 1992 nt2.98□□□□□ -1.93
ATG41Q12048 FAA1YOR317W 2103 nt2.98□□□□□ -1.93
ATG41Q12048 CNN1YFR046C 1086 nt2.98□□□□□ -1.93
ATG41Q12048 GEP4YHR100C 558 nt2.98□□□□□ -1.93
ATG41Q12048 AIM22YJL046W 1230 nt2.98□□□□□ -1.93
ATG41Q12048 YAE1YJR067C 426 nt2.98□□□□□ -1.93
ATG41Q12048 YNL320WYNL320W 855 nt2.98□□□□□ -1.93
ATG41Q12048 PLP2YOR281C 861 nt2.98□□□□□ -1.93
ATG41Q12048 YOR289WYOR289W 756 nt2.98□□□□□ -1.93
ATG41Q12048 HST1YOL068C 1512 nt2.98□□□□□ -1.93
ATG41Q12048 TFB2YPL122C 1542 nt2.98□□□□□ -1.93
ATG41Q12048 STV1YMR054W 2673 nt2.97□□□□□ -1.93
ATG41Q12048 HEF3YNL014W 3135 nt2.97□□□□□ -1.93
ATG41Q12048 YDL176WYDL176W 2127 nt2.97□□□□□ -1.93
ATG41Q12048 NUS1YDL193W 1128 nt2.97□□□□□ -1.93
ATG41Q12048 YER085CYER085C 522 nt2.97□□□□□ -1.93
ATG41Q12048 RPL17AYKL180W 555 nt2.97□□□□□ -1.93
ATG41Q12048 CWC25YNL245C 540 nt2.97□□□□□ -1.93
ATG41Q12048 NAT3YPR131C 588 nt2.97□□□□□ -1.93
ATG41Q12048 RSC1YGR056W 2787 nt2.97□□□□□ -1.93
ATG41Q12048 MDM38YOL027C 1722 nt2.96□□□□□ -1.93
ATG41Q12048 YRM1YOR172W 2361 nt2.96□□□□□ -1.94
ATG41Q12048 UGA3YDL170W 1587 nt2.96□□□□□ -1.94
ATG41Q12048 SPI1YER150W 447 nt2.96□□□□□ -1.94
ATG41Q12048 YGL082WYGL082W 1146 nt2.96□□□□□ -1.94
ATG41Q12048 YGR291CYGR291C 222 nt2.96□□□□□ -1.94
ATG41Q12048 YAL064W-BYAL064W-B 381 nt2.96□□□□□ -1.94
ATG41Q12048 GOT1YMR292W 417 nt2.96□□□□□ -1.94
ATG41Q12048 RET3YPL010W 570 nt2.96□□□□□ -1.94
ATG41Q12048 INA17YPL099C 549 nt2.96□□□□□ -1.94
ATG41Q12048 YBR298C-AYBR298C-A 222 nt2.96□□□□□ -1.94
ATG41Q12048 SYF1YDR416W 2580 nt2.96□□□□□ -1.94
ATG41Q12048 YFR045WYFR045W 930 nt2.95□□□□□ -1.94
ATG41Q12048 YGL132WYGL132W 336 nt2.95□□□□□ -1.94
ATG41Q12048 FOL2YGR267C 732 nt2.95□□□□□ -1.94
ATG41Q12048 RPL22AYLR061W 366 nt2.95□□□□□ -1.94
ATG41Q12048 ATG8YBL078C 354 nt2.95□□□□□ -1.94
ATG41Q12048 PDR12YPL058C 4536 nt2.95□□□□□ -1.94
ATG41Q12048 PTR3YFR029W 2037 nt2.95□□□□□ -1.94
ATG41Q12048 NAM2YLR382C 2685 nt2.95□□□□□ -1.94
ATG41Q12048 JEN1YKL217W 1851 nt2.94□□□□□ -1.94
ATG41Q12048 GCN1YGL195W 8019 nt2.94□□□□□ -1.94
ATG41Q12048 TAF10YDR167W 621 nt2.94□□□□□ -1.94
ATG41Q12048 TYS1YGR185C 1185 nt2.94□□□□□ -1.94
ATG41Q12048 RFC3YNL290W 1023 nt2.94□□□□□ -1.94
ATG41Q12048 SSL1YLR005W 1386 nt2.94□□□□□ -1.94
ATG41Q12048 ATG32YIL146C 1590 nt2.94□□□□□ -1.94
ATG41Q12048 YDR444WYDR444W 2064 nt2.94□□□□□ -1.94
ATG41Q12048 BCH2YKR027W 2298 nt2.94□□□□□ -1.94
ATG41Q12048 RPN6YDL097C 1305 nt2.93□□□□□ -1.94
ATG41Q12048 KTR6YPL053C 1341 nt2.93□□□□□ -1.94
ATG41Q12048 RAD54YGL163C 2697 nt2.93□□□□□ -1.94
ATG41Q12048 RTS1YOR014W 2274 nt2.93□□□□□ -1.94
ATG41Q12048 YCR050CYCR050C 309 nt2.93□□□□□ -1.94
ATG41Q12048 YDL071CYDL071C 375 nt2.93□□□□□ -1.94
ATG41Q12048 DET1YDR051C 1005 nt2.93□□□□□ -1.94
ATG41Q12048 IES6YEL044W 501 nt2.93□□□□□ -1.94
ATG41Q12048 MTC3YGL226W 372 nt2.93□□□□□ -1.94
ATG41Q12048 CDC12YHR107C 1224 nt2.93□□□□□ -1.94
ATG41Q12048 YNL013CYNL013C 378 nt2.93□□□□□ -1.94
ATG41Q12048 INN1YNL152W 1230 nt2.93□□□□□ -1.94
ATG41Q12048 CMD1YBR109C 444 nt2.93□□□□□ -1.94
ATG41Q12048 YMR317WYMR317W 3423 nt2.93□□□□□ -1.94
ATG41Q12048 CIN8YEL061C 3003 nt2.93□□□□□ -1.94
ATG41Q12048 FLO9YAL063C 3969 nt2.93□□□□□ -1.94
ATG41Q12048 REC8YPR007C 2043 nt2.93□□□□□ -1.94
ATG41Q12048 IME4YGL192W 1803 nt2.93□□□□□ -1.94
ATG41Q12048 HPR1YDR138W 2259 nt2.93□□□□□ -1.94
ATG41Q12048 BYE1YKL005C 1785 nt2.92□□□□□ -1.94
ATG41Q12048 MIG3YER028C 1185 nt2.92□□□□□ -1.94
ATG41Q12048 YPL073CYPL073C 486 nt2.92□□□□□ -1.94
ATG41Q12048 YAR1YPL239W 603 nt2.92□□□□□ -1.94
ATG41Q12048 DRS2YAL026C 4068 nt2.92□□□□□ -1.94
ATG41Q12048 APP1YNL094W 1764 nt2.92□□□□□ -1.94
ATG41Q12048 PCI8YIL071C 1335 nt2.92□□□□□ -1.94
ATG41Q12048 MCD4YKL165C 2760 nt2.91□□□□□ -1.94
ATG41Q12048 YGL188CYGL188C 174 nt2.91□□□□□ -1.94
ATG41Q12048 VMA22YHR060W 546 nt2.91□□□□□ -1.94
ATG41Q12048 YIL175WYIL175W 318 nt2.91□□□□□ -1.94
ATG41Q12048 YJL222W-BYJL222W-B 138 nt2.91□□□□□ -1.94
ATG41Q12048 YLR122CYLR122C 378 nt2.91□□□□□ -1.94
ATG41Q12048 IBD2YNL164C 1056 nt2.91□□□□□ -1.94
ATG41Q12048 YPL014WYPL014W 1146 nt2.91□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 46.6 ms