Protein–RNA interactions for Protein: Q12045

VIK1, Spindle pole body-associated protein VIK1, yeast

Predictions only

Length 647 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VIK1	Q12045	YBR225W	YBR225W	2703 nt		3.7	□□□□□ -1.82
VIK1	Q12045	HEF3	YNL014W	3135 nt		3.7	□□□□□ -1.82
VIK1	Q12045	DOS2	YDR068W	933 nt		3.7	□□□□□ -1.82
VIK1	Q12045	RTN1	YDR233C	888 nt		3.7	□□□□□ -1.82
VIK1	Q12045	YJR038C	YJR038C	363 nt		3.7	□□□□□ -1.82
VIK1	Q12045	DAN1	YJR150C	897 nt		3.7	□□□□□ -1.82
VIK1	Q12045	FOL3	YMR113W	1284 nt		3.7	□□□□□ -1.82
VIK1	Q12045	OAZ1	YPL052W	879 nt		3.7	□□□□□ -1.82
VIK1	Q12045	POC4	YPL144W	447 nt		3.7	□□□□□ -1.82
VIK1	Q12045	YPL168W	YPL168W	1293 nt		3.7	□□□□□ -1.82
VIK1	Q12045	RNT1	YMR239C	1416 nt		3.7	□□□□□ -1.82
VIK1	Q12045	SEC2	YNL272C	2280 nt		3.69	□□□□□ -1.82
VIK1	Q12045	LSM6	YDR378C	261 nt		3.69	□□□□□ -1.82
VIK1	Q12045	YFL065C	YFL065C	309 nt		3.69	□□□□□ -1.82
VIK1	Q12045	RAI1	YGL246C	1164 nt		3.69	□□□□□ -1.82
VIK1	Q12045	YHR137C-A	YHR137C-A	651 nt		3.69	□□□□□ -1.82
VIK1	Q12045	BNA1	YJR025C	534 nt		3.69	□□□□□ -1.82
VIK1	Q12045	VTA1	YLR181C	993 nt		3.69	□□□□□ -1.82
VIK1	Q12045	VPS71	YML041C	843 nt		3.69	□□□□□ -1.82
VIK1	Q12045	SNF8	YPL002C	702 nt		3.69	□□□□□ -1.82
VIK1	Q12045	YPL071C	YPL071C	471 nt		3.69	□□□□□ -1.82
VIK1	Q12045	GLO3	YER122C	1482 nt		3.68	□□□□□ -1.82
VIK1	Q12045	REB1	YBR049C	2433 nt		3.68	□□□□□ -1.82
VIK1	Q12045	PCL9	YDL179W	915 nt		3.68	□□□□□ -1.82
VIK1	Q12045	MAG1	YER142C	891 nt		3.68	□□□□□ -1.82
VIK1	Q12045	REH1	YLR387C	1299 nt		3.68	□□□□□ -1.82
VIK1	Q12045	TPP1	YMR156C	717 nt		3.68	□□□□□ -1.82
VIK1	Q12045	MFA2	YNL145W	117 nt		3.68	□□□□□ -1.82
VIK1	Q12045	YOR131C	YOR131C	657 nt		3.68	□□□□□ -1.82
VIK1	Q12045	SIR1	YKR101W	1965 nt		3.68	□□□□□ -1.82
VIK1	Q12045	ASI1	YMR119W	1875 nt		3.68	□□□□□ -1.82
VIK1	Q12045	PHO12	YHR215W	1404 nt		3.68	□□□□□ -1.82
VIK1	Q12045	PHO11	YAR071W	1404 nt		3.68	□□□□□ -1.82
VIK1	Q12045	NOP6	YDL213C	678 nt		3.67	□□□□□ -1.82
VIK1	Q12045	YDR249C	YDR249C	1122 nt		3.67	□□□□□ -1.82
VIK1	Q12045	YGL193C	YGL193C	312 nt		3.67	□□□□□ -1.82
VIK1	Q12045	MIC26	YGR235C	702 nt		3.67	□□□□□ -1.82
VIK1	Q12045	tV(CAC)D	tV(CAC)D	73 nt		3.67	□□□□□ -1.82
VIK1	Q12045	tV(CAC)H	tV(CAC)H	73 nt		3.67	□□□□□ -1.82
VIK1	Q12045	YNK1	YKL067W	462 nt		3.67	□□□□□ -1.82
VIK1	Q12045	YLR326W	YLR326W	723 nt		3.67	□□□□□ -1.82
VIK1	Q12045	YLR462W	YLR462W	609 nt		3.67	□□□□□ -1.82
VIK1	Q12045	YML116W-A	YML116W-A	303 nt		3.67	□□□□□ -1.82
VIK1	Q12045	MED7	YOL135C	669 nt		3.67	□□□□□ -1.82
VIK1	Q12045	YPL088W	YPL088W	1029 nt		3.67	□□□□□ -1.82
VIK1	Q12045	GZF3	YJL110C	1656 nt		3.67	□□□□□ -1.82
VIK1	Q12045	SAS4	YDR181C	1446 nt		3.67	□□□□□ -1.82
VIK1	Q12045	FOX2	YKR009C	2703 nt		3.67	□□□□□ -1.82
VIK1	Q12045	ERG26	YGL001C	1050 nt		3.66	□□□□□ -1.82
VIK1	Q12045	HIS5	YIL116W	1158 nt		3.66	□□□□□ -1.82
VIK1	Q12045	YJR096W	YJR096W	849 nt		3.66	□□□□□ -1.82
VIK1	Q12045	YAR023C	YAR023C	540 nt		3.66	□□□□□ -1.82
VIK1	Q12045	CMR3	YPR013C	954 nt		3.66	□□□□□ -1.82
VIK1	Q12045	YBR134W	YBR134W	402 nt		3.66	□□□□□ -1.82
VIK1	Q12045	AZR1	YGR224W	1842 nt		3.65	□□□□□ -1.82
VIK1	Q12045	YLR177W	YLR177W	1887 nt		3.65	□□□□□ -1.82
VIK1	Q12045	ORC4	YPR162C	1590 nt		3.65	□□□□□ -1.82
VIK1	Q12045	TRM13	YOL125W	1431 nt		3.65	□□□□□ -1.83
VIK1	Q12045	UPS2	YLR168C	693 nt		3.65	□□□□□ -1.83
VIK1	Q12045	AIM41	YOR215C	558 nt		3.65	□□□□□ -1.83
VIK1	Q12045	URA2	YJL130C	6645 nt		3.65	□□□□□ -1.83
VIK1	Q12045	PMT6	YGR199W	2280 nt		3.65	□□□□□ -1.83
VIK1	Q12045	MUP3	YHL036W	1641 nt		3.65	□□□□□ -1.83
VIK1	Q12045	YJR030C	YJR030C	2238 nt		3.64	□□□□□ -1.83
VIK1	Q12045	YKL050C	YKL050C	2769 nt		3.64	□□□□□ -1.83
VIK1	Q12045	VID27	YNL212W	2349 nt		3.64	□□□□□ -1.83
VIK1	Q12045	snR57	snR57	88 nt		3.64	□□□□□ -1.83
VIK1	Q12045	MRT4	YKL009W	711 nt		3.64	□□□□□ -1.83
VIK1	Q12045	RPP0	YLR340W	939 nt		3.64	□□□□□ -1.83
VIK1	Q12045	LTO1	YNL260C	597 nt		3.64	□□□□□ -1.83
VIK1	Q12045	YOL019W	YOL019W	1656 nt		3.64	□□□□□ -1.83
VIK1	Q12045	RTT109	YLL002W	1311 nt		3.64	□□□□□ -1.83
VIK1	Q12045	RTS1	YOR014W	2274 nt		3.64	□□□□□ -1.83
VIK1	Q12045	KIN2	YLR096W	3444 nt		3.64	□□□□□ -1.83
VIK1	Q12045	LOS1	YKL205W	3303 nt		3.64	□□□□□ -1.83
VIK1	Q12045	RMD1	YDL001W	1293 nt		3.63	□□□□□ -1.83
VIK1	Q12045	FCF1	YDR339C	570 nt		3.63	□□□□□ -1.83
VIK1	Q12045	YJR037W	YJR037W	384 nt		3.63	□□□□□ -1.83
VIK1	Q12045	TAF4	YMR005W	1167 nt		3.63	□□□□□ -1.83
VIK1	Q12045	EOS1	YNL080C	1101 nt		3.63	□□□□□ -1.83
VIK1	Q12045	ARX1	YDR101C	1782 nt		3.63	□□□□□ -1.83
VIK1	Q12045	SUC2	YIL162W	1599 nt		3.63	□□□□□ -1.83
VIK1	Q12045	TAF1	YGR274C	3201 nt		3.62	□□□□□ -1.83
VIK1	Q12045	NGL3	YML118W	1518 nt		3.62	□□□□□ -1.83
VIK1	Q12045	RSM25	YIL093C	795 nt		3.62	□□□□□ -1.83
VIK1	Q12045	POG1	YIL122W	1056 nt		3.62	□□□□□ -1.83
VIK1	Q12045	CDA2	YLR308W	939 nt		3.62	□□□□□ -1.83
VIK1	Q12045	BMS1	YPL217C	3552 nt		3.62	□□□□□ -1.83
VIK1	Q12045	ALG11	YNL048W	1647 nt		3.62	□□□□□ -1.83
VIK1	Q12045	TRS120	YDR407C	3870 nt		3.62	□□□□□ -1.83
VIK1	Q12045	IMD4	YML056C	1575 nt		3.61	□□□□□ -1.83
VIK1	Q12045	PHO92	YDR374C	921 nt		3.61	□□□□□ -1.83
VIK1	Q12045	YFL041W-A	YFL041W-A	192 nt		3.61	□□□□□ -1.83
VIK1	Q12045	YGR051C	YGR051C	324 nt		3.61	□□□□□ -1.83
VIK1	Q12045	YHI9	YHR029C	885 nt		3.61	□□□□□ -1.83
VIK1	Q12045	AUR1	YKL004W	1206 nt		3.61	□□□□□ -1.83
VIK1	Q12045	SHH3	YMR118C	591 nt		3.61	□□□□□ -1.83
VIK1	Q12045	PRX1	YBL064C	786 nt		3.61	□□□□□ -1.83
VIK1	Q12045	PFA4	YOL003C	1137 nt		3.61	□□□□□ -1.83
VIK1	Q12045	GLO4	YOR040W	858 nt		3.61	□□□□□ -1.83

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