Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LMOD3Q0VAK6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LMOD3Q0VAK6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LMOD3Q0VAK6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LMOD3Q0VAK6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LMOD3Q0VAK6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LMOD3Q0VAK6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LMOD3Q0VAK6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LMOD3Q0VAK6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LMOD3Q0VAK6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LMOD3Q0VAK6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LMOD3Q0VAK6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LMOD3Q0VAK6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LMOD3Q0VAK6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LMOD3Q0VAK6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LMOD3Q0VAK6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LMOD3Q0VAK6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LMOD3Q0VAK6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LMOD3Q0VAK6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LMOD3Q0VAK6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LMOD3Q0VAK6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LMOD3Q0VAK6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LMOD3Q0VAK6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LMOD3Q0VAK6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LMOD3Q0VAK6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LMOD3Q0VAK6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
LMOD3Q0VAK6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LMOD3Q0VAK6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LMOD3Q0VAK6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LMOD3Q0VAK6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LMOD3Q0VAK6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LMOD3Q0VAK6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LMOD3Q0VAK6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LMOD3Q0VAK6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LMOD3Q0VAK6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LMOD3Q0VAK6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LMOD3Q0VAK6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LMOD3Q0VAK6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LMOD3Q0VAK6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LMOD3Q0VAK6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LMOD3Q0VAK6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LMOD3Q0VAK6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LMOD3Q0VAK6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LMOD3Q0VAK6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LMOD3Q0VAK6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LMOD3Q0VAK6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
LMOD3Q0VAK6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LMOD3Q0VAK6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LMOD3Q0VAK6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LMOD3Q0VAK6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LMOD3Q0VAK6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LMOD3Q0VAK6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LMOD3Q0VAK6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LMOD3Q0VAK6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
LMOD3Q0VAK6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LMOD3Q0VAK6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LMOD3Q0VAK6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LMOD3Q0VAK6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMOD3Q0VAK6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMOD3Q0VAK6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMOD3Q0VAK6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMOD3Q0VAK6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMOD3Q0VAK6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMOD3Q0VAK6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMOD3Q0VAK6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMOD3Q0VAK6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMOD3Q0VAK6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMOD3Q0VAK6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMOD3Q0VAK6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMOD3Q0VAK6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMOD3Q0VAK6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMOD3Q0VAK6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMOD3Q0VAK6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMOD3Q0VAK6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMOD3Q0VAK6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMOD3Q0VAK6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LMOD3Q0VAK6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LMOD3Q0VAK6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LMOD3Q0VAK6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LMOD3Q0VAK6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LMOD3Q0VAK6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LMOD3Q0VAK6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LMOD3Q0VAK6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LMOD3Q0VAK6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LMOD3Q0VAK6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LMOD3Q0VAK6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LMOD3Q0VAK6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
LMOD3Q0VAK6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LMOD3Q0VAK6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LMOD3Q0VAK6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LMOD3Q0VAK6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LMOD3Q0VAK6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LMOD3Q0VAK6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LMOD3Q0VAK6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LMOD3Q0VAK6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LMOD3Q0VAK6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LMOD3Q0VAK6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LMOD3Q0VAK6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LMOD3Q0VAK6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LMOD3Q0VAK6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms