Protein–RNA interactions for Protein: Q05948

YLR225C, Uncharacterized SVF1-like protein YLR225C, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR225CQ05948 TRM8YDL201W 861 nt5.33□□□□□ -1.56
YLR225CQ05948 NRG1YDR043C 696 nt5.33□□□□□ -1.56
YLR225CQ05948 NBP2YDR162C 711 nt5.33□□□□□ -1.56
YLR225CQ05948 MIC26YGR235C 702 nt5.33□□□□□ -1.56
YLR225CQ05948 BAT2YJR148W 1131 nt5.33□□□□□ -1.56
YLR225CQ05948 YKL202WYKL202W 582 nt5.33□□□□□ -1.56
YLR225CQ05948 REC102YLR329W 795 nt5.33□□□□□ -1.56
YLR225CQ05948 CSR1YLR380W 1227 nt5.33□□□□□ -1.56
YLR225CQ05948 YIM1YMR152W 1098 nt5.33□□□□□ -1.56
YLR225CQ05948 RPA49YNL248C 1248 nt5.33□□□□□ -1.56
YLR225CQ05948 snR37snR37 386 nt5.33□□□□□ -1.56
YLR225CQ05948 VTH1YIL173W 4650 nt5.33□□□□□ -1.56
YLR225CQ05948 VTH2YJL222W 4650 nt5.33□□□□□ -1.56
YLR225CQ05948 RNR3YIL066C 2610 nt5.32□□□□□ -1.56
YLR225CQ05948 YER067C-AYER067C-A 324 nt5.32□□□□□ -1.56
YLR225CQ05948 YFR009W-AYFR009W-A 258 nt5.32□□□□□ -1.56
YLR225CQ05948 ERJ5YFR041C 888 nt5.32□□□□□ -1.56
YLR225CQ05948 YGL041W-AYGL041W-A 465 nt5.32□□□□□ -1.56
YLR225CQ05948 TYW3YGL050W 822 nt5.32□□□□□ -1.56
YLR225CQ05948 SCW10YMR305C 1170 nt5.32□□□□□ -1.56
YLR225CQ05948 YOR238WYOR238W 912 nt5.32□□□□□ -1.56
YLR225CQ05948 YPL114WYPL114W 420 nt5.32□□□□□ -1.56
YLR225CQ05948 CIN2YPL241C 807 nt5.32□□□□□ -1.56
YLR225CQ05948 PDI1YCL043C 1569 nt5.32□□□□□ -1.56
YLR225CQ05948 HAP4YKL109W 1665 nt5.31□□□□□ -1.56
YLR225CQ05948 SUM1YDR310C 3189 nt5.31□□□□□ -1.56
YLR225CQ05948 YCR050CYCR050C 309 nt5.31□□□□□ -1.56
YLR225CQ05948 YGL152CYGL152C 678 nt5.31□□□□□ -1.56
YLR225CQ05948 VMA22YHR060W 546 nt5.31□□□□□ -1.56
YLR225CQ05948 YHR193C-AYHR193C-A 375 nt5.31□□□□□ -1.56
YLR225CQ05948 KTI12YKL110C 942 nt5.31□□□□□ -1.56
YLR225CQ05948 DLT1YMR126C 1029 nt5.31□□□□□ -1.56
YLR225CQ05948 YNL035CYNL035C 1170 nt5.31□□□□□ -1.56
YLR225CQ05948 YOR283WYOR283W 693 nt5.31□□□□□ -1.56
YLR225CQ05948 LEU1YGL009C 2340 nt5.31□□□□□ -1.56
YLR225CQ05948 UGA1YGR019W 1416 nt5.31□□□□□ -1.56
YLR225CQ05948 HPR1YDR138W 2259 nt5.3□□□□□ -1.56
YLR225CQ05948 RNA15YGL044C 891 nt5.3□□□□□ -1.56
YLR225CQ05948 EMC4YGL231C 573 nt5.3□□□□□ -1.56
YLR225CQ05948 NAT2YGR147C 867 nt5.3□□□□□ -1.56
YLR225CQ05948 YNL013CYNL013C 378 nt5.3□□□□□ -1.56
YLR225CQ05948 YNR062CYNR062C 984 nt5.3□□□□□ -1.56
YLR225CQ05948 PFK27YOL136C 1194 nt5.3□□□□□ -1.56
YLR225CQ05948 YOR366WYOR366W 354 nt5.3□□□□□ -1.56
YLR225CQ05948 ECM23YPL021W 564 nt5.3□□□□□ -1.56
YLR225CQ05948 CUP9YPL177C 921 nt5.3□□□□□ -1.56
YLR225CQ05948 UGA2YBR006W 1494 nt5.3□□□□□ -1.56
YLR225CQ05948 POL12YBL035C 2118 nt5.3□□□□□ -1.56
YLR225CQ05948 HSP104YLL026W 2727 nt5.3□□□□□ -1.56
YLR225CQ05948 ECM3YOR092W 1842 nt5.3□□□□□ -1.56
YLR225CQ05948 YFL051CYFL051C 483 nt5.29□□□□□ -1.56
YLR225CQ05948 SIP2YGL208W 1248 nt5.29□□□□□ -1.56
YLR225CQ05948 YGR115CYGR115C 780 nt5.29□□□□□ -1.56
YLR225CQ05948 MMF1YIL051C 438 nt5.29□□□□□ -1.56
YLR225CQ05948 YAR019W-AYAR019W-A 333 nt5.29□□□□□ -1.56
YLR225CQ05948 SEC14YMR079W 915 nt5.29□□□□□ -1.56
YLR225CQ05948 YMR085WYMR085W 1299 nt5.29□□□□□ -1.56
YLR225CQ05948 YMR315WYMR315W 1050 nt5.29□□□□□ -1.56
YLR225CQ05948 COG5YNL051W 1212 nt5.29□□□□□ -1.56
YLR225CQ05948 ATG8YBL078C 354 nt5.29□□□□□ -1.56
YLR225CQ05948 ERV15YBR210W 429 nt5.29□□□□□ -1.56
YLR225CQ05948 DPH6YLR143W 2058 nt5.28□□□□□ -1.56
YLR225CQ05948 AZR1YGR224W 1842 nt5.28□□□□□ -1.56
YLR225CQ05948 PTK2YJR059W 2457 nt5.28□□□□□ -1.56
YLR225CQ05948 CRD1YDL142C 852 nt5.28□□□□□ -1.56
YLR225CQ05948 YDR203WYDR203W 318 nt5.28□□□□□ -1.56
YLR225CQ05948 LSM4YER112W 564 nt5.28□□□□□ -1.56
YLR225CQ05948 YGL109WYGL109W 324 nt5.28□□□□□ -1.56
YLR225CQ05948 YGR064WYGR064W 369 nt5.28□□□□□ -1.56
YLR225CQ05948 MTM1YGR257C 1101 nt5.28□□□□□ -1.56
YLR225CQ05948 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt5.28□□□□□ -1.56
YLR225CQ05948 GCD14YJL125C 1152 nt5.28□□□□□ -1.56
YLR225CQ05948 MET14YKL001C 609 nt5.28□□□□□ -1.56
YLR225CQ05948 HMX1YLR205C 954 nt5.28□□□□□ -1.56
YLR225CQ05948 RRN9YMR270C 1098 nt5.28□□□□□ -1.56
YLR225CQ05948 TOM7YNL070W 183 nt5.28□□□□□ -1.56
YLR225CQ05948 NRK1YNL129W 723 nt5.28□□□□□ -1.56
YLR225CQ05948 COX11YPL132W 903 nt5.28□□□□□ -1.56
YLR225CQ05948 PPT2YPL148C 522 nt5.28□□□□□ -1.56
YLR225CQ05948 OXR1YPL196W 822 nt5.28□□□□□ -1.56
YLR225CQ05948 AMA1YGR225W 1782 nt5.28□□□□□ -1.56
YLR225CQ05948 SLI1YGR212W 1407 nt5.28□□□□□ -1.56
YLR225CQ05948 PDH1YPR002W 1551 nt5.28□□□□□ -1.56
YLR225CQ05948 SSH4YKL124W 1740 nt5.28□□□□□ -1.56
YLR225CQ05948 MAG2YLR427W 2013 nt5.28□□□□□ -1.56
YLR225CQ05948 YGL176CYGL176C 1665 nt5.28□□□□□ -1.56
YLR225CQ05948 MCM6YGL201C 3054 nt5.27□□□□□ -1.57
YLR225CQ05948 MEF1YLR069C 2286 nt5.27□□□□□ -1.57
YLR225CQ05948 ZUO1YGR285C 1302 nt5.27□□□□□ -1.57
YLR225CQ05948 RXT3YDL076C 885 nt5.27□□□□□ -1.57
YLR225CQ05948 DAS2YDR020C 699 nt5.27□□□□□ -1.57
YLR225CQ05948 GLO2YDR272W 825 nt5.27□□□□□ -1.57
YLR225CQ05948 YGL132WYGL132W 336 nt5.27□□□□□ -1.57
YLR225CQ05948 RPL27AYHR010W 411 nt5.27□□□□□ -1.57
YLR225CQ05948 CAP2YIL034C 864 nt5.27□□□□□ -1.57
YLR225CQ05948 SWD2YKL018W 990 nt5.27□□□□□ -1.57
YLR225CQ05948 YMR130WYMR130W 909 nt5.27□□□□□ -1.57
YLR225CQ05948 NIS1YNL078W 1224 nt5.27□□□□□ -1.57
YLR225CQ05948 GDB1YPR184W 4611 nt5.27□□□□□ -1.57
YLR225CQ05948 SPR28YDR218C 1272 nt5.26□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.8 ms