Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2BQ00403 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2BQ00403 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2BQ00403 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2BQ00403 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2BQ00403 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2BQ00403 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2BQ00403 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2BQ00403 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2BQ00403 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2BQ00403 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2BQ00403 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2BQ00403 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2BQ00403 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2BQ00403 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2BQ00403 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2BQ00403 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2BQ00403 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2BQ00403 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2BQ00403 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2BQ00403 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2BQ00403 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2BQ00403 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2BQ00403 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2BQ00403 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2BQ00403 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2BQ00403 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF2BQ00403 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF2BQ00403 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF2BQ00403 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF2BQ00403 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF2BQ00403 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF2BQ00403 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF2BQ00403 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF2BQ00403 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF2BQ00403 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
GTF2BQ00403 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2BQ00403 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2BQ00403 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2BQ00403 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2BQ00403 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2BQ00403 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2BQ00403 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2BQ00403 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2BQ00403 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2BQ00403 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2BQ00403 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2BQ00403 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GTF2BQ00403 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GTF2BQ00403 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GTF2BQ00403 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GTF2BQ00403 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GTF2BQ00403 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GTF2BQ00403 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GTF2BQ00403 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GTF2BQ00403 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF2BQ00403 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF2BQ00403 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF2BQ00403 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF2BQ00403 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF2BQ00403 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF2BQ00403 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF2BQ00403 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF2BQ00403 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF2BQ00403 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF2BQ00403 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF2BQ00403 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF2BQ00403 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF2BQ00403 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF2BQ00403 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF2BQ00403 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF2BQ00403 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF2BQ00403 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF2BQ00403 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF2BQ00403 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF2BQ00403 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF2BQ00403 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF2BQ00403 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF2BQ00403 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF2BQ00403 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF2BQ00403 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF2BQ00403 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF2BQ00403 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF2BQ00403 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF2BQ00403 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF2BQ00403 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF2BQ00403 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF2BQ00403 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF2BQ00403 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF2BQ00403 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF2BQ00403 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2BQ00403 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2BQ00403 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2BQ00403 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2BQ00403 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2BQ00403 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2BQ00403 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2BQ00403 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2BQ00403 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2BQ00403 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms