Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113P63121 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113P63121 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113P63121 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113P63121 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113P63121 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113P63121 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113P63121 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113P63121 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113P63121 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113P63121 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113P63121 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113P63121 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113P63121 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113P63121 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113P63121 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113P63121 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113P63121 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113P63121 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113P63121 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113P63121 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113P63121 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113P63121 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113P63121 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113P63121 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113P63121 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113P63121 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113P63121 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113P63121 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113P63121 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113P63121 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113P63121 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113P63121 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113P63121 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113P63121 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113P63121 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113P63121 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113P63121 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113P63121 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113P63121 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113P63121 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113P63121 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113P63121 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113P63121 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113P63121 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113P63121 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113P63121 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113P63121 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113P63121 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113P63121 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HERVK_113P63121 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HERVK_113P63121 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
HERVK_113P63121 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HERVK_113P63121 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
HERVK_113P63121 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HERVK_113P63121 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HERVK_113P63121 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HERVK_113P63121 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HERVK_113P63121 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HERVK_113P63121 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HERVK_113P63121 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HERVK_113P63121 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HERVK_113P63121 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HERVK_113P63121 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
HERVK_113P63121 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HERVK_113P63121 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HERVK_113P63121 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HERVK_113P63121 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HERVK_113P63121 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113P63121 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113P63121 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113P63121 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113P63121 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113P63121 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113P63121 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113P63121 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113P63121 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113P63121 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113P63121 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113P63121 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113P63121 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113P63121 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113P63121 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113P63121 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113P63121 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113P63121 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113P63121 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113P63121 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms