Protein–RNA interactions for Protein: P62306

SNRPF, Small nuclear ribonucleoprotein F, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPFP62306 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNRPFP62306 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNRPFP62306 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNRPFP62306 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNRPFP62306 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNRPFP62306 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNRPFP62306 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNRPFP62306 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNRPFP62306 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNRPFP62306 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNRPFP62306 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNRPFP62306 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNRPFP62306 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNRPFP62306 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SNRPFP62306 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SNRPFP62306 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SNRPFP62306 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
SNRPFP62306 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SNRPFP62306 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SNRPFP62306 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNRPFP62306 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNRPFP62306 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNRPFP62306 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNRPFP62306 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SNRPFP62306 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNRPFP62306 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNRPFP62306 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNRPFP62306 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNRPFP62306 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNRPFP62306 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNRPFP62306 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNRPFP62306 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNRPFP62306 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SNRPFP62306 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNRPFP62306 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNRPFP62306 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNRPFP62306 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNRPFP62306 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SNRPFP62306 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SNRPFP62306 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNRPFP62306 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNRPFP62306 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNRPFP62306 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNRPFP62306 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNRPFP62306 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNRPFP62306 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNRPFP62306 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SNRPFP62306 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNRPFP62306 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNRPFP62306 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNRPFP62306 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNRPFP62306 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNRPFP62306 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNRPFP62306 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNRPFP62306 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNRPFP62306 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNRPFP62306 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNRPFP62306 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNRPFP62306 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SNRPFP62306 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNRPFP62306 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNRPFP62306 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNRPFP62306 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNRPFP62306 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SNRPFP62306 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNRPFP62306 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNRPFP62306 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNRPFP62306 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNRPFP62306 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNRPFP62306 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNRPFP62306 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNRPFP62306 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNRPFP62306 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNRPFP62306 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNRPFP62306 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNRPFP62306 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNRPFP62306 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNRPFP62306 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNRPFP62306 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNRPFP62306 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNRPFP62306 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNRPFP62306 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNRPFP62306 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNRPFP62306 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNRPFP62306 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SNRPFP62306 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SNRPFP62306 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNRPFP62306 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SNRPFP62306 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNRPFP62306 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNRPFP62306 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNRPFP62306 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNRPFP62306 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNRPFP62306 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNRPFP62306 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNRPFP62306 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNRPFP62306 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNRPFP62306 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNRPFP62306 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNRPFP62306 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms