Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR2FP61218 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR2FP61218 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR2FP61218 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR2FP61218 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR2FP61218 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR2FP61218 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR2FP61218 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR2FP61218 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR2FP61218 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR2FP61218 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR2FP61218 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR2FP61218 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR2FP61218 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR2FP61218 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR2FP61218 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR2FP61218 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR2FP61218 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR2FP61218 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR2FP61218 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR2FP61218 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR2FP61218 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR2FP61218 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR2FP61218 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR2FP61218 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR2FP61218 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR2FP61218 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR2FP61218 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR2FP61218 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR2FP61218 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR2FP61218 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR2FP61218 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR2FP61218 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR2FP61218 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR2FP61218 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR2FP61218 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR2FP61218 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR2FP61218 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR2FP61218 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR2FP61218 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR2FP61218 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR2FP61218 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR2FP61218 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR2FP61218 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR2FP61218 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR2FP61218 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR2FP61218 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR2FP61218 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR2FP61218 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR2FP61218 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR2FP61218 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR2FP61218 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR2FP61218 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR2FP61218 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR2FP61218 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR2FP61218 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR2FP61218 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR2FP61218 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR2FP61218 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR2FP61218 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR2FP61218 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR2FP61218 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR2FP61218 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR2FP61218 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR2FP61218 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR2FP61218 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR2FP61218 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR2FP61218 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR2FP61218 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR2FP61218 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR2FP61218 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR2FP61218 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR2FP61218 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR2FP61218 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR2FP61218 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
POLR2FP61218 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
POLR2FP61218 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
POLR2FP61218 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLR2FP61218 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLR2FP61218 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
POLR2FP61218 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLR2FP61218 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR2FP61218 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR2FP61218 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR2FP61218 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR2FP61218 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR2FP61218 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR2FP61218 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR2FP61218 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR2FP61218 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR2FP61218 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR2FP61218 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR2FP61218 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR2FP61218 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR2FP61218 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR2FP61218 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR2FP61218 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR2FP61218 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR2FP61218 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR2FP61218 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms