Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RHBDL3P58872 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RHBDL3P58872 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RHBDL3P58872 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RHBDL3P58872 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RHBDL3P58872 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RHBDL3P58872 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RHBDL3P58872 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RHBDL3P58872 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RHBDL3P58872 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
RHBDL3P58872 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RHBDL3P58872 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RHBDL3P58872 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RHBDL3P58872 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RHBDL3P58872 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
RHBDL3P58872 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RHBDL3P58872 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RHBDL3P58872 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RHBDL3P58872 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RHBDL3P58872 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RHBDL3P58872 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RHBDL3P58872 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RHBDL3P58872 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
RHBDL3P58872 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
RHBDL3P58872 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RHBDL3P58872 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RHBDL3P58872 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RHBDL3P58872 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RHBDL3P58872 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RHBDL3P58872 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RHBDL3P58872 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RHBDL3P58872 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RHBDL3P58872 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
RHBDL3P58872 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RHBDL3P58872 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RHBDL3P58872 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RHBDL3P58872 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RHBDL3P58872 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RHBDL3P58872 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RHBDL3P58872 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RHBDL3P58872 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RHBDL3P58872 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RHBDL3P58872 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
RHBDL3P58872 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RHBDL3P58872 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RHBDL3P58872 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RHBDL3P58872 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RHBDL3P58872 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RHBDL3P58872 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RHBDL3P58872 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RHBDL3P58872 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RHBDL3P58872 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RHBDL3P58872 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RHBDL3P58872 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RHBDL3P58872 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RHBDL3P58872 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RHBDL3P58872 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RHBDL3P58872 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RHBDL3P58872 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RHBDL3P58872 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RHBDL3P58872 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RHBDL3P58872 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RHBDL3P58872 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RHBDL3P58872 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RHBDL3P58872 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RHBDL3P58872 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RHBDL3P58872 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RHBDL3P58872 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RHBDL3P58872 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RHBDL3P58872 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RHBDL3P58872 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RHBDL3P58872 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RHBDL3P58872 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
RHBDL3P58872 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RHBDL3P58872 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RHBDL3P58872 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RHBDL3P58872 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RHBDL3P58872 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RHBDL3P58872 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RHBDL3P58872 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RHBDL3P58872 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RHBDL3P58872 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RHBDL3P58872 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RHBDL3P58872 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RHBDL3P58872 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RHBDL3P58872 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RHBDL3P58872 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RHBDL3P58872 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RHBDL3P58872 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RHBDL3P58872 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RHBDL3P58872 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RHBDL3P58872 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RHBDL3P58872 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RHBDL3P58872 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RHBDL3P58872 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RHBDL3P58872 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RHBDL3P58872 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RHBDL3P58872 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RHBDL3P58872 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RHBDL3P58872 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms