Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BACE1P56817 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BACE1P56817 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
BACE1P56817 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BACE1P56817 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
BACE1P56817 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BACE1P56817 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BACE1P56817 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BACE1P56817 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BACE1P56817 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
BACE1P56817 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BACE1P56817 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BACE1P56817 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BACE1P56817 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BACE1P56817 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BACE1P56817 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BACE1P56817 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BACE1P56817 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BACE1P56817 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BACE1P56817 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
BACE1P56817 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BACE1P56817 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BACE1P56817 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BACE1P56817 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BACE1P56817 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BACE1P56817 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BACE1P56817 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BACE1P56817 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BACE1P56817 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BACE1P56817 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BACE1P56817 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
BACE1P56817 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BACE1P56817 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BACE1P56817 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BACE1P56817 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BACE1P56817 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BACE1P56817 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
BACE1P56817 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BACE1P56817 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BACE1P56817 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BACE1P56817 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BACE1P56817 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BACE1P56817 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BACE1P56817 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BACE1P56817 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BACE1P56817 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BACE1P56817 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BACE1P56817 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BACE1P56817 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BACE1P56817 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BACE1P56817 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BACE1P56817 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BACE1P56817 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BACE1P56817 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BACE1P56817 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BACE1P56817 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BACE1P56817 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BACE1P56817 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BACE1P56817 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BACE1P56817 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BACE1P56817 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BACE1P56817 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BACE1P56817 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BACE1P56817 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BACE1P56817 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BACE1P56817 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BACE1P56817 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BACE1P56817 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BACE1P56817 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BACE1P56817 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BACE1P56817 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BACE1P56817 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BACE1P56817 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BACE1P56817 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BACE1P56817 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BACE1P56817 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BACE1P56817 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BACE1P56817 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BACE1P56817 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BACE1P56817 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BACE1P56817 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BACE1P56817 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
BACE1P56817 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BACE1P56817 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BACE1P56817 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BACE1P56817 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
BACE1P56817 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BACE1P56817 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BACE1P56817 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BACE1P56817 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BACE1P56817 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BACE1P56817 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BACE1P56817 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BACE1P56817 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BACE1P56817 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BACE1P56817 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BACE1P56817 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BACE1P56817 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BACE1P56817 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BACE1P56817 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms