Protein–RNA interactions for Protein: P55160

NCKAP1L, Nck-associated protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKAP1LP55160 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCKAP1LP55160 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCKAP1LP55160 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCKAP1LP55160 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NCKAP1LP55160 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCKAP1LP55160 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NCKAP1LP55160 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NCKAP1LP55160 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCKAP1LP55160 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCKAP1LP55160 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NCKAP1LP55160 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCKAP1LP55160 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCKAP1LP55160 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCKAP1LP55160 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCKAP1LP55160 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCKAP1LP55160 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCKAP1LP55160 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCKAP1LP55160 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCKAP1LP55160 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCKAP1LP55160 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCKAP1LP55160 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCKAP1LP55160 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCKAP1LP55160 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NCKAP1LP55160 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCKAP1LP55160 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCKAP1LP55160 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCKAP1LP55160 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCKAP1LP55160 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCKAP1LP55160 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCKAP1LP55160 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCKAP1LP55160 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCKAP1LP55160 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCKAP1LP55160 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCKAP1LP55160 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCKAP1LP55160 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCKAP1LP55160 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCKAP1LP55160 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCKAP1LP55160 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCKAP1LP55160 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCKAP1LP55160 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCKAP1LP55160 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCKAP1LP55160 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCKAP1LP55160 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCKAP1LP55160 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCKAP1LP55160 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCKAP1LP55160 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCKAP1LP55160 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NCKAP1LP55160 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCKAP1LP55160 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCKAP1LP55160 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCKAP1LP55160 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCKAP1LP55160 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCKAP1LP55160 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NCKAP1LP55160 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCKAP1LP55160 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCKAP1LP55160 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCKAP1LP55160 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCKAP1LP55160 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCKAP1LP55160 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCKAP1LP55160 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCKAP1LP55160 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCKAP1LP55160 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCKAP1LP55160 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCKAP1LP55160 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCKAP1LP55160 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NCKAP1LP55160 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCKAP1LP55160 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCKAP1LP55160 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCKAP1LP55160 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCKAP1LP55160 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCKAP1LP55160 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCKAP1LP55160 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCKAP1LP55160 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCKAP1LP55160 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCKAP1LP55160 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCKAP1LP55160 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCKAP1LP55160 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCKAP1LP55160 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCKAP1LP55160 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCKAP1LP55160 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCKAP1LP55160 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NCKAP1LP55160 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCKAP1LP55160 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCKAP1LP55160 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCKAP1LP55160 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCKAP1LP55160 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCKAP1LP55160 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCKAP1LP55160 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCKAP1LP55160 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCKAP1LP55160 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCKAP1LP55160 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCKAP1LP55160 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCKAP1LP55160 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCKAP1LP55160 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NCKAP1LP55160 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NCKAP1LP55160 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NCKAP1LP55160 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NCKAP1LP55160 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NCKAP1LP55160 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NCKAP1LP55160 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms